More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1240 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  100 
 
 
249 aa  509  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  73.06 
 
 
247 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  73.06 
 
 
247 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  69.01 
 
 
243 aa  357  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  65.29 
 
 
246 aa  348  5e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  48.96 
 
 
244 aa  239  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  53.81 
 
 
254 aa  222  4.9999999999999996e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  45.12 
 
 
407 aa  217  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  41.67 
 
 
254 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 
254 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 
254 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  42.86 
 
 
649 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  42.26 
 
 
250 aa  202  3e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  43.62 
 
 
254 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  43.44 
 
 
605 aa  201  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  46.7 
 
 
424 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  44.13 
 
 
408 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.13 
 
 
256 aa  198  7e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  42.5 
 
 
242 aa  198  7.999999999999999e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  47.03 
 
 
415 aa  198  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  45.92 
 
 
247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.97 
 
 
393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  44.9 
 
 
816 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  50.25 
 
 
464 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  42.79 
 
 
246 aa  194  8.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
469 aa  194  1e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
465 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  42.17 
 
 
409 aa  193  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
465 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
465 aa  193  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
465 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
465 aa  193  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
469 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.72 
 
 
471 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2181  ABC transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 
396 aa  192  5e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.623057  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  44.55 
 
 
450 aa  191  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  44.76 
 
 
472 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  40.51 
 
 
246 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  41.38 
 
 
399 aa  189  4e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  43.78 
 
 
456 aa  188  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  44.44 
 
 
429 aa  188  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  47.21 
 
 
423 aa  188  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
413 aa  188  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.43 
 
 
397 aa  187  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  45.69 
 
 
711 aa  187  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  46.94 
 
 
472 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  41.95 
 
 
260 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  44 
 
 
419 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  40.99 
 
 
254 aa  186  4e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  43.94 
 
 
418 aa  185  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.84 
 
 
415 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.94 
 
 
449 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  43.35 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  44.67 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  42.5 
 
 
438 aa  182  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  41.63 
 
 
392 aa  182  4.0000000000000006e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.91 
 
 
454 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  43.84 
 
 
418 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  45.45 
 
 
439 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  44.08 
 
 
488 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  43.33 
 
 
406 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  43.65 
 
 
405 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  45.45 
 
 
422 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  41.29 
 
 
416 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  43.78 
 
 
443 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  39.09 
 
 
448 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  40.26 
 
 
427 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  39.71 
 
 
422 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.4 
 
 
400 aa  179  2.9999999999999997e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  43.37 
 
 
549 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  44.16 
 
 
421 aa  179  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  42.35 
 
 
427 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  41.78 
 
 
429 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  38.59 
 
 
424 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  43.22 
 
 
369 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
419 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  44.85 
 
 
266 aa  178  5.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.16 
 
 
421 aa  178  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  45.45 
 
 
427 aa  178  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  41.38 
 
 
446 aa  178  8e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  43.54 
 
 
390 aa  178  9e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  42.57 
 
 
422 aa  177  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  39.64 
 
 
395 aa  177  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  43.54 
 
 
390 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  43.65 
 
 
421 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  43.65 
 
 
406 aa  177  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  41.95 
 
 
478 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  44.39 
 
 
424 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  42 
 
 
433 aa  177  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  47.54 
 
 
420 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  41.38 
 
 
435 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  44.5 
 
 
418 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  41.29 
 
 
594 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  45.6 
 
 
400 aa  176  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  41.95 
 
 
410 aa  176  3e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.9 
 
 
468 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  37.78 
 
 
412 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
411 aa  176  4e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  46.28 
 
 
418 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>