More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0816 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  518  1e-146  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  67.36 
 
 		 605 aa  353  2e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  58.85 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  51.88 
 
 		 649 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  52.26 
 
 		 247 aa  259  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  44.44 
 
 		 438 aa  233  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  46.99 
 
 		 422 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  45.6 
 
 		 443 aa  229  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  46.41 
 
 		 418 aa  228  7e-59  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  47.66 
 
 		 429 aa  226  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.46 
 
 		 407 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  44.72 
 
 		 457 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  45.12 
 
 		 468 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  44.67 
 
 		 400 aa  223  3e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  45.15 
 
 		 250 aa  223  3e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1240  ABC transporter related  53.81 
 
 		 249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  45.71 
 
 		 488 aa  222  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  45.87 
 
 		 456 aa  221  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  44.49 
 
 		 450 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44 
 
 		 421 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.44 
 
 		 393 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0209  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.34 
 
 		 397 aa  220  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  47.44 
 
 		 264 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  48.03 
 
 		 254 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  44.35 
 
 		 711 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  48.29 
 
 		 816 aa  218  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 		 416 aa  218  7.999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  43.7 
 
 		 415 aa  218  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  50.24 
 
 		 422 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  45.71 
 
 		 422 aa  217  2e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.81 
 
 		 400 aa  217  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  45.83 
 
 		 253 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  46.96 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  46.96 
 
 		 247 aa  215  5e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  44.22 
 
 		 870 aa  214  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  43.9 
 
 		 464 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  49.07 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  49.07 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  44.49 
 
 		 428 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  48.02 
 
 		 431 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  50.49 
 
 		 493 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  49.75 
 
 		 427 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  43.55 
 
 		 424 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  46.04 
 
 		 422 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  46.61 
 
 		 420 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  44.4 
 
 		 472 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  48.61 
 
 		 254 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  45.71 
 
 		 449 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  44.26 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  46.22 
 
 		 411 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  41.99 
 
 		 409 aa  211  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  44.22 
 
 		 435 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  48.02 
 
 		 422 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  46.08 
 
 		 246 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  44.74 
 
 		 418 aa  211  1e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 465 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 465 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 465 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 469 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 465 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.26 
 
 		 465 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  41.57 
 
 		 427 aa  210  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 471 aa  210  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  49.5 
 
 		 429 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  41.56 
 
 		 424 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.55 
 
 		 454 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  46.82 
 
 		 415 aa  209  5e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  44.87 
 
 		 247 aa  208  5e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  47.39 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  43.75 
 
 		 420 aa  208  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  41.77 
 
 		 408 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0319  ABC transporter related  42.04 
 
 		 455 aa  207  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.746089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  42.02 
 
 		 430 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 439 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  51.06 
 
 		 429 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  41.53 
 
 		 472 aa  207  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  45.65 
 
 		 428 aa  206  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  46.31 
 
 		 437 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  43.19 
 
 		 446 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  46.04 
 
 		 469 aa  206  4e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  45.87 
 
 		 423 aa  206  4e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  49.07 
 
 		 390 aa  205  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  42.15 
 
 		 472 aa  205  6e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.27 
 
 		 435 aa  205  7e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  49.07 
 
 		 390 aa  204  8e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  41.74 
 
 		 246 aa  204  9e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1066  ABC transporter related  43.75 
 
 		 399 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  43.33 
 
 		 394 aa  204  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  46.57 
 
 		 429 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  41.46 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  47.03 
 
 		 411 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  45.33 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  43.7 
 
 		 415 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  45.95 
 
 		 418 aa  202  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  47.5 
 
 		 439 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  49.01 
 
 		 418 aa  201  8e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.88 
 
 		 256 aa  201  8e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>