More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1221 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  100 
 
 
253 aa  509  1e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  59.83 
 
 
253 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  55.1 
 
 
261 aa  277  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  55.79 
 
 
296 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0520  ABC transporter related  55.02 
 
 
249 aa  240  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0432  ABC transporter related  57.71 
 
 
249 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390783  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  48.4 
 
 
422 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  47.27 
 
 
420 aa  228  6e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  52.76 
 
 
428 aa  226  2e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  53.77 
 
 
420 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  46.86 
 
 
433 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  45.11 
 
 
244 aa  221  7e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  46.51 
 
 
429 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  48.29 
 
 
411 aa  220  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  47.93 
 
 
421 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  50.75 
 
 
431 aa  218  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  44.66 
 
 
427 aa  218  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.59 
 
 
417 aa  218  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  49.51 
 
 
415 aa  218  8.999999999999998e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  45.49 
 
 
428 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  51.22 
 
 
418 aa  216  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  51.5 
 
 
439 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  45.1 
 
 
422 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  45.83 
 
 
254 aa  216  4e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  46.55 
 
 
254 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  51.26 
 
 
369 aa  214  7e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  43.68 
 
 
437 aa  214  8e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  43.92 
 
 
422 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  47.37 
 
 
429 aa  213  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  41.25 
 
 
649 aa  211  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  51.09 
 
 
245 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  42.19 
 
 
418 aa  211  1e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  45.49 
 
 
241 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  43.14 
 
 
422 aa  208  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.42 
 
 
247 aa  207  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  48.74 
 
 
418 aa  207  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  48.53 
 
 
395 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  44.98 
 
 
241 aa  206  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  46.46 
 
 
427 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  47.34 
 
 
429 aa  206  3e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.17 
 
 
419 aa  206  3e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  42.02 
 
 
424 aa  206  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  43.3 
 
 
429 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.55 
 
 
256 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  41.74 
 
 
430 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  43.48 
 
 
435 aa  205  6e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  50.25 
 
 
420 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  42.74 
 
 
456 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  44.58 
 
 
423 aa  204  8e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  46.38 
 
 
266 aa  204  9e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  48.74 
 
 
439 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  49.25 
 
 
433 aa  204  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  47.84 
 
 
254 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  44.63 
 
 
472 aa  204  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  47.84 
 
 
254 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  44.83 
 
 
411 aa  203  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  45.89 
 
 
454 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  44.86 
 
 
446 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  44.77 
 
 
443 aa  203  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  42.97 
 
 
411 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  47.41 
 
 
254 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  48.04 
 
 
450 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.03 
 
 
449 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  46.83 
 
 
431 aa  202  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  48.54 
 
 
250 aa  202  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  45.89 
 
 
264 aa  202  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  48.5 
 
 
493 aa  202  5e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  44.86 
 
 
427 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  40 
 
 
419 aa  201  6e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  42.61 
 
 
429 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  44.18 
 
 
870 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  48.6 
 
 
432 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  49.73 
 
 
488 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.28 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  44.21 
 
 
435 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  47.34 
 
 
411 aa  200  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  44.71 
 
 
405 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  46.8 
 
 
464 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  48.56 
 
 
435 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  41.63 
 
 
418 aa  199  3e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2267  O-antigen export system ATP-binding protein RfbB  43.44 
 
 
246 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  44.96 
 
 
420 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  47.6 
 
 
428 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.5 
 
 
468 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  41.18 
 
 
422 aa  198  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  43.36 
 
 
605 aa  198  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  40.17 
 
 
440 aa  198  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  45 
 
 
416 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  45 
 
 
438 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  40.62 
 
 
472 aa  197  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  45 
 
 
447 aa  197  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  41.1 
 
 
425 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  40.08 
 
 
405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  42.13 
 
 
408 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
469 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
270 aa  195  5.000000000000001e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  43.1 
 
 
424 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  43.51 
 
 
262 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
465 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  44.7 
 
 
465 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>