More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3870 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3870  ABC transporter related protein  100 
 
 		 296 aa  604  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  79.44 
 
 		 261 aa  417  1e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5670  ABC transporter related protein  60 
 
 		 253 aa  305  5.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0520  ABC transporter related  59.09 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940922  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1221  ABC transporter related  55.79 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.507597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0432  ABC transporter related  57.85 
 
 		 249 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  50.22 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  49.78 
 
 		 418 aa  221  8e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  44.11 
 
 		 429 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  41.52 
 
 		 439 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  41.82 
 
 		 424 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  42.26 
 
 		 649 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  39.65 
 
 		 420 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  49.04 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  45.37 
 
 		 449 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  46.19 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.93 
 
 		 454 aa  208  9e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  44.12 
 
 		 244 aa  207  2e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  41.38 
 
 		 870 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  39.58 
 
 		 464 aa  206  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  40.67 
 
 		 429 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  38.65 
 
 		 420 aa  205  6e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  48.33 
 
 		 415 aa  205  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  41.48 
 
 		 423 aa  205  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.77 
 
 		 417 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  45.92 
 
 		 428 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  41.86 
 
 		 397 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 411 aa  204  2e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  41.86 
 
 		 397 aa  203  2e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2572  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 245 aa  203  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 419 aa  203  3e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  42.98 
 
 		 428 aa  202  5e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  39.1 
 
 		 418 aa  202  6e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  40.38 
 
 		 493 aa  202  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  44.04 
 
 		 369 aa  201  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  41.87 
 
 		 429 aa  202  8e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  41.09 
 
 		 418 aa  201  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  43.41 
 
 		 446 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  45.83 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  45.83 
 
 		 254 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  43.6 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  38.1 
 
 		 438 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1182  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 418 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  44.3 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  46.43 
 
 		 443 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  38.16 
 
 		 429 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  44.9 
 
 		 457 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  45.45 
 
 		 427 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  39.01 
 
 		 422 aa  199  3e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  45.18 
 
 		 468 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.64 
 
 		 450 aa  199  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  45.42 
 
 		 254 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  39.13 
 
 		 437 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  42.8 
 
 		 411 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  41.16 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  41.6 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  42.45 
 
 		 429 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  45.62 
 
 		 427 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  41.25 
 
 		 435 aa  197  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  44.73 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  42.8 
 
 		 422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  43.95 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  39.15 
 
 		 433 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  41.95 
 
 		 241 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  47.53 
 
 		 256 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  43.04 
 
 		 419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0638  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  44.58 
 
 		 472 aa  195  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  42.34 
 
 		 435 aa  195  6e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  37.37 
 
 		 427 aa  195  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03166  ABC transporter, ATP binding protein  45.38 
 
 		 437 aa  195  8.000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  44.26 
 
 		 435 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  45.81 
 
 		 456 aa  195  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08890  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  45.11 
 
 		 247 aa  195  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.382609 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  39.93 
 
 		 411 aa  194  1e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  47.78 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  41.1 
 
 		 241 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  43.16 
 
 		 266 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  42.67 
 
 		 428 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  44.12 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  47.06 
 
 		 439 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  40.57 
 
 		 433 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  42.98 
 
 		 448 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  37.63 
 
 		 605 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  40.07 
 
 		 409 aa  192  8e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 270 aa  191  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  46.24 
 
 		 488 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  44.84 
 
 		 447 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3885  ABC transporter related  43.51 
 
 		 264 aa  190  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.0148555 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 390 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  41.26 
 
 		 390 aa  190  2e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  43.11 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  43.18 
 
 		 418 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  42.06 
 
 		 420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  46.53 
 
 		 474 aa  189  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4190  ABC transporter related  51.32 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  47.34 
 
 		 395 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  46.53 
 
 		 474 aa  189  5e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3460  ABC transporter ATP-binding protein  40.27 
 
 		 440 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.100585  normal  0.102308 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>