More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1186 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  100 
 
 
272 aa  549  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  94.23 
 
 
269 aa  500  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  91.12 
 
 
273 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  91.12 
 
 
273 aa  480  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  90.73 
 
 
295 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  84.13 
 
 
273 aa  461  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  78.35 
 
 
264 aa  404  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  76.28 
 
 
277 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  73.77 
 
 
268 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  71.14 
 
 
253 aa  361  8e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  69.72 
 
 
271 aa  356  1.9999999999999998e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
258 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  46.67 
 
 
258 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  51.44 
 
 
246 aa  252  4.0000000000000004e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  48.97 
 
 
249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  48.1 
 
 
263 aa  242  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  47.54 
 
 
249 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  47.13 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  47.13 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  47.93 
 
 
250 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  47.93 
 
 
250 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  49.79 
 
 
248 aa  236  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  47.33 
 
 
254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  46.91 
 
 
249 aa  230  2e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  48.05 
 
 
233 aa  228  7e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  46.19 
 
 
241 aa  226  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  48.23 
 
 
242 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  41.39 
 
 
247 aa  221  7e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  47.77 
 
 
242 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  43.97 
 
 
236 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  43.53 
 
 
236 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  43.53 
 
 
236 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  44.07 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  40.33 
 
 
271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  46.73 
 
 
252 aa  193  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  41.63 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  46.19 
 
 
237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  40.51 
 
 
242 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  38.63 
 
 
254 aa  186  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  43.22 
 
 
437 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
270 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  40.64 
 
 
408 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  40.54 
 
 
409 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  39.02 
 
 
448 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  36.25 
 
 
244 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
419 aa  179  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  39.38 
 
 
234 aa  179  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  39.22 
 
 
424 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  41 
 
 
605 aa  177  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.41 
 
 
247 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  42.13 
 
 
415 aa  176  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  34.96 
 
 
443 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  38.18 
 
 
407 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.88 
 
 
472 aa  172  5e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  37.5 
 
 
392 aa  172  6.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  39.59 
 
 
418 aa  172  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  35.69 
 
 
458 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
422 aa  171  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  39.29 
 
 
247 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  39.29 
 
 
247 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  39.39 
 
 
816 aa  170  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  41.21 
 
 
649 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  36.82 
 
 
427 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  35.24 
 
 
254 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  42.93 
 
 
439 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  38.58 
 
 
429 aa  171  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  39.66 
 
 
250 aa  169  4e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  41.41 
 
 
422 aa  169  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.99 
 
 
454 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0396  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
395 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  40.61 
 
 
420 aa  169  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.5 
 
 
450 aa  168  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  40.82 
 
 
594 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0490  ABC transporter related  39.44 
 
 
257 aa  168  9e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  41.41 
 
 
412 aa  168  1e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0594  ABC transporter related  41.84 
 
 
260 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  40.91 
 
 
428 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  40.38 
 
 
425 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  39.59 
 
 
420 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26780  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  34.77 
 
 
264 aa  167  2e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.77258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  39.34 
 
 
251 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  35.37 
 
 
429 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  40.91 
 
 
429 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  39.8 
 
 
410 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  37.39 
 
 
424 aa  166  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  40.4 
 
 
429 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  35.5 
 
 
478 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  41.84 
 
 
493 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0939  ABC transporter related  40.7 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00388911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  36.73 
 
 
427 aa  165  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  37.18 
 
 
456 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  39.59 
 
 
419 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  37.86 
 
 
418 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  41.92 
 
 
418 aa  165  5.9999999999999996e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  34.81 
 
 
449 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  37.44 
 
 
464 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  35.86 
 
 
400 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  35.95 
 
 
429 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  37.73 
 
 
422 aa  165  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  38.61 
 
 
472 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>