More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0742 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  100 
 
 
269 aa  547  1e-155  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  51.05 
 
 
263 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  46.22 
 
 
246 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  46.22 
 
 
246 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  48.32 
 
 
247 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  46.64 
 
 
246 aa  234  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  45.27 
 
 
271 aa  233  3e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  46.09 
 
 
253 aa  229  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.25 
 
 
268 aa  229  5e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
277 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  46.31 
 
 
249 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  45.34 
 
 
264 aa  224  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  47.13 
 
 
250 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  47.13 
 
 
250 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  45.02 
 
 
233 aa  223  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  46.19 
 
 
241 aa  222  6e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  46.55 
 
 
236 aa  221  7e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  46.55 
 
 
236 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  46.55 
 
 
236 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  45.49 
 
 
249 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  47.19 
 
 
242 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  44.07 
 
 
269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  45.96 
 
 
258 aa  218  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  45.96 
 
 
258 aa  218  8.999999999999998e-56  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  43.57 
 
 
273 aa  217  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  45.78 
 
 
249 aa  216  4e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  44.07 
 
 
272 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  44.13 
 
 
248 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  43.78 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  43.78 
 
 
273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  43.78 
 
 
295 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  43.09 
 
 
254 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  44.59 
 
 
242 aa  204  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  38.65 
 
 
250 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  42.01 
 
 
468 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  41.46 
 
 
421 aa  190  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  39.42 
 
 
271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
416 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  37.64 
 
 
424 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
439 aa  187  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  43.94 
 
 
418 aa  186  3e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  42.72 
 
 
252 aa  185  6e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  40.53 
 
 
427 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  40.39 
 
 
427 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  36.25 
 
 
419 aa  183  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  45.96 
 
 
369 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  44.95 
 
 
428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  43.6 
 
 
418 aa  181  9.000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.94 
 
 
415 aa  181  1e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  40.61 
 
 
447 aa  181  1e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
411 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40 
 
 
407 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.91 
 
 
417 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  39 
 
 
392 aa  180  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  37.19 
 
 
435 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  43.39 
 
 
242 aa  179  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  46.84 
 
 
252 aa  179  4.999999999999999e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 
250 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
393 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.32 
 
 
393 aa  178  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  40.8 
 
 
408 aa  178  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  35.8 
 
 
649 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  42.93 
 
 
428 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  43.27 
 
 
429 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  43.43 
 
 
420 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
429 aa  176  3e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  43.43 
 
 
422 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0767  ABC transporter related  41.33 
 
 
406 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281524  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  39.73 
 
 
433 aa  176  4e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 
270 aa  176  5e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  39.48 
 
 
422 aa  175  6e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  37.13 
 
 
423 aa  175  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  40.29 
 
 
419 aa  174  9e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  42.42 
 
 
420 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.84 
 
 
488 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  37.97 
 
 
424 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  40.95 
 
 
406 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  38.14 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  38.14 
 
 
472 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  34.84 
 
 
390 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  34.84 
 
 
390 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1434  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  38.89 
 
 
400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.74682  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  40.1 
 
 
456 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  37.87 
 
 
410 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  39.73 
 
 
422 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  43.43 
 
 
411 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  44.97 
 
 
437 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  35.57 
 
 
410 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  33.47 
 
 
415 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  36.59 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  36.44 
 
 
254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  41.62 
 
 
412 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  42.71 
 
 
422 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  41.85 
 
 
420 aa  172  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  33.86 
 
 
394 aa  172  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  43.78 
 
 
422 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.76 
 
 
415 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  42.35 
 
 
594 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
431 aa  171  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.63 
 
 
454 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>