More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0880 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  99.58 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  99.58 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  54.51 
 
 		 246 aa  262  4e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  51.08 
 
 		 233 aa  253  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  48.26 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  51.29 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  51.29 
 
 		 246 aa  243  1.9999999999999999e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  49.34 
 
 		 242 aa  241  1e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  47.84 
 
 		 263 aa  237  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  50.43 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  50.43 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  47.41 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  47.41 
 
 		 250 aa  229  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  47.41 
 
 		 249 aa  225  4e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  47.41 
 
 		 249 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  46.98 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  45.34 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  46.55 
 
 		 269 aa  221  6e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  44.02 
 
 		 253 aa  220  9.999999999999999e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  43.22 
 
 		 277 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  43.4 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  43.4 
 
 		 273 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  43.97 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  44.44 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  44.21 
 
 		 269 aa  217  1e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  43.4 
 
 		 295 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  45.7 
 
 		 248 aa  214  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  44.87 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  41.1 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  41.13 
 
 		 242 aa  203  2e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.37 
 
 		 268 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  42.04 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  43.4 
 
 		 271 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  46.81 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  42.34 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  42.93 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  44.21 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0705  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  37.45 
 
 		 264 aa  168  6e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0611  ABC transporter  42.63 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.36 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01371  hypothetical protein  38.99 
 
 		 234 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3347  ABC transporter-like  40.76 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532829  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  39.22 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  41.58 
 
 		 474 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  41.58 
 
 		 474 aa  162  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  37.39 
 
 		 459 aa  162  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5200  ABC transporter-like protein protein  40.11 
 
 		 243 aa  161  6e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0414197  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  34.48 
 
 		 400 aa  162  6e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  37.28 
 
 		 244 aa  161  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  40.84 
 
 		 416 aa  160  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  41.36 
 
 		 390 aa  160  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  37.73 
 
 		 425 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 		 393 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  34.62 
 
 		 478 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  39.27 
 
 		 410 aa  159  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.84 
 
 		 390 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  38.22 
 
 		 419 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 419 aa  159  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  37.5 
 
 		 816 aa  158  8e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.04 
 
 		 421 aa  158  9e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  37.77 
 
 		 472 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  37.55 
 
 		 254 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.04 
 
 		 421 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7047  putative O-antigen export system ATP-binding protein  37.61 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.772214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  38.95 
 
 		 427 aa  156  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  35.34 
 
 		 443 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.79 
 
 		 649 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  36.71 
 
 		 458 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  36.9 
 
 		 405 aa  154  9e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.74 
 
 		 450 aa  154  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 549 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  37.77 
 
 		 408 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  34.21 
 
 		 438 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  40.96 
 
 		 392 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  36.82 
 
 		 420 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  38.81 
 
 		 421 aa  153  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  38.95 
 
 		 472 aa  153  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  37.17 
 
 		 429 aa  153  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  35.78 
 
 		 870 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  35.5 
 
 		 449 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  41.53 
 
 		 605 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  35.98 
 
 		 432 aa  152  2.9999999999999998e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  38.5 
 
 		 406 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  34.48 
 
 		 394 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  40.54 
 
 		 464 aa  152  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27970  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39.59 
 
 		 352 aa  152  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  35.6 
 
 		 493 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0028  ABC transporter related  37.17 
 
 		 472 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  38.3 
 
 		 424 aa  151  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  39.34 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  39.34 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 405 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  40.84 
 
 		 435 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.06 
 
 		 454 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  35.24 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  42.41 
 
 		 446 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  37.74 
 
 		 428 aa  150  1e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>