More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0487 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  100 
 
 		 242 aa  494  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  46.32 
 
 		 246 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  46.55 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  47.19 
 
 		 242 aa  228  5e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 253 aa  228  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  46.32 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  48.05 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  48.05 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  48.05 
 
 		 250 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 277 aa  225  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  47.62 
 
 		 249 aa  224  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  44.59 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  44.59 
 
 		 246 aa  223  2e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  48.05 
 
 		 271 aa  222  4e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  47.77 
 
 		 272 aa  220  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  47.96 
 
 		 269 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  47.96 
 
 		 295 aa  218  8.999999999999998e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  47.56 
 
 		 264 aa  217  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  47.96 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  45.69 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  43.95 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  47.96 
 
 		 273 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  43.53 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  46.75 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  45.22 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  46.9 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  46.9 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  44.49 
 
 		 249 aa  205  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  44.59 
 
 		 269 aa  204  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  42.61 
 
 		 254 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  41.13 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  41.13 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  41.13 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  42.27 
 
 		 400 aa  184  9e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  41.13 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.41 
 
 		 435 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  43.81 
 
 		 408 aa  179  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  41.67 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  45.5 
 
 		 439 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  41.74 
 
 		 423 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  40.08 
 
 		 418 aa  176  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  40.27 
 
 		 390 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 390 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  46.2 
 
 		 816 aa  175  6e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  38.7 
 
 		 450 aa  175  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  42.04 
 
 		 424 aa  175  7e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  44.86 
 
 		 432 aa  175  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  46.15 
 
 		 447 aa  174  8e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  39.04 
 
 		 410 aa  174  8e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  45.16 
 
 		 422 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  37.89 
 
 		 271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  43.78 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0494  ABC transporter  38.18 
 
 		 394 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.491328  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  39.72 
 
 		 474 aa  172  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  43.46 
 
 		 242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  41.1 
 
 		 421 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  45.79 
 
 		 429 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  40.83 
 
 		 429 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4932  ABC transporter related  40.43 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.672175  normal  0.649349 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  39.25 
 
 		 474 aa  171  1e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  40.52 
 
 		 438 aa  171  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  45.65 
 
 		 439 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  47.28 
 
 		 392 aa  171  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  47.31 
 
 		 437 aa  171  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  44.32 
 
 		 428 aa  170  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  38.7 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  41.59 
 
 		 428 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  38.6 
 
 		 649 aa  169  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.39 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 419 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  37.29 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  43.15 
 
 		 415 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1779  lipopolysaccharide ABC export system, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 405 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0028065 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  36.82 
 
 		 419 aa  169  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  44.02 
 
 		 711 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1731  ABC transporter-related protein  42.78 
 
 		 410 aa  169  5e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  42.52 
 
 		 411 aa  169  5e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  40.61 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  38.7 
 
 		 472 aa  168  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  40.61 
 
 		 254 aa  168  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  41.4 
 
 		 472 aa  168  6e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  45.95 
 
 		 418 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  44.74 
 
 		 422 aa  168  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  44.09 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.56 
 
 		 393 aa  167  1e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  44.26 
 
 		 402 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  40.21 
 
 		 247 aa  166  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  45.74 
 
 		 420 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  41.59 
 
 		 409 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  40 
 
 		 427 aa  166  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  44.81 
 
 		 468 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  42.78 
 
 		 420 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  42.41 
 
 		 433 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  38.65 
 
 		 406 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  37.9 
 
 		 478 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  41.55 
 
 		 405 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  42.16 
 
 		 416 aa  166  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  42.08 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>