More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0519 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0519  O-antigen export system ATP-binding protein RfbE  100 
 
 
252 aa  506  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  98.45 
 
 
231 aa  382  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3131  ABC transporter related  63.1 
 
 
251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0395  ABC transporter related  46.34 
 
 
250 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0877  ABC transporter related  46.34 
 
 
250 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0745  ABC transporter related  46.34 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.751265  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0848  ABC transporter related  45.71 
 
 
249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.174284 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4065  ABC transporter-like  41.46 
 
 
252 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2627  lipopolysaccharide/O-antigen transport protein  39.92 
 
 
271 aa  204  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6710  ABC transporter related  44.08 
 
 
254 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2482  ABC transporter related  45.96 
 
 
237 aa  196  3e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.68747  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4101  ABC transporter related protein  41.49 
 
 
264 aa  195  5.000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13815  O-antigen/lipopolysaccharide transport ATP-binding protein ABC transporter rfbE  42.21 
 
 
273 aa  195  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.617285 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4322  ABC transporter related protein  47 
 
 
253 aa  195  8.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5372  ABC transporter related  42.11 
 
 
295 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  41.39 
 
 
247 aa  192  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3138  ABC transporter related  45.18 
 
 
248 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.303207  normal  0.442523 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4991  ABC transporter related  41.7 
 
 
273 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.672251  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5079  ABC transporter related  41.7 
 
 
273 aa  191  8e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.991153 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2779  ABC transporter related  40.65 
 
 
263 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5618  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
269 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0277  ABC transporter related protein  44.12 
 
 
277 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1186  ABC transporter related  41.63 
 
 
272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.573649  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0133  ABC transporter related  38.59 
 
 
271 aa  188  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.700741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0764  ABC transporter related  42.36 
 
 
233 aa  186  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  42.08 
 
 
369 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2683  ABC transporter related  46.23 
 
 
246 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01500  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  39 
 
 
268 aa  184  9e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0290922 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  46.6 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  46.6 
 
 
258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  39.26 
 
 
244 aa  183  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5660  putative O-antigen/LPS export system ATP-binding protein  38.37 
 
 
249 aa  183  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  41.55 
 
 
432 aa  182  5.0000000000000004e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2739  ABC transporter related  39.02 
 
 
247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2421  ABC transporter related  40 
 
 
241 aa  182  6e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.115818 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1877  ABC transporter ATPase  44.92 
 
 
242 aa  182  6e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.476797 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2056  ABC transporter related  44.72 
 
 
246 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.597294  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2140  ABC transporter ATP-binding protein  44.72 
 
 
246 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.33 
 
 
415 aa  180  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  42.42 
 
 
242 aa  180  2e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
415 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  38.01 
 
 
418 aa  179  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  38.37 
 
 
270 aa  179  4e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0742  ABC transporter related  46.84 
 
 
269 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  38.52 
 
 
464 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  37.65 
 
 
419 aa  177  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 
594 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  40.72 
 
 
429 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  42.56 
 
 
390 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2691  ABC transporter related  38.91 
 
 
241 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0219599  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0918  ABC transporter  38.42 
 
 
405 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.441705  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  42.56 
 
 
390 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  40.59 
 
 
423 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  44 
 
 
816 aa  175  5e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  42.05 
 
 
649 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  38.57 
 
 
437 aa  175  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.09 
 
 
417 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0847  ABC transporter domain-containing protein  43.43 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.320257  hitchhiker  0.00000409414 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0783  ABC transporter domain protein  43.43 
 
 
236 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.335784  normal  0.0578487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14680  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  40.95 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.21715  hitchhiker  0.00000227338 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
393 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  41.41 
 
 
428 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0880  ABC transporter domain protein  42.93 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.900741  normal  0.269412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  41.18 
 
 
438 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  44.56 
 
 
429 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  41.5 
 
 
435 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  40.25 
 
 
411 aa  172  5.999999999999999e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  38.11 
 
 
331 aa  172  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  42.5 
 
 
422 aa  171  7.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  36.95 
 
 
478 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  41.82 
 
 
418 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  40.2 
 
 
450 aa  171  1e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  38.46 
 
 
254 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0491  ABC transporter related  41.12 
 
 
241 aa  171  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  40.61 
 
 
416 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  36.49 
 
 
419 aa  170  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  38.94 
 
 
472 aa  169  3e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  39.61 
 
 
415 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 
433 aa  169  3e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  38.86 
 
 
427 aa  169  4e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  40.4 
 
 
406 aa  169  4e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  36.44 
 
 
422 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  37.12 
 
 
428 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  39.23 
 
 
418 aa  168  8e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4145  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
429 aa  168  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179677 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0487  ABC transporter related protein  44.09 
 
 
242 aa  167  1e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  41.1 
 
 
392 aa  167  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.9 
 
 
421 aa  166  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  42.79 
 
 
409 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  35.98 
 
 
429 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  39.39 
 
 
439 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  42.79 
 
 
407 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71940  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  39.9 
 
 
421 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5476  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
413 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.34 
 
 
488 aa  166  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3117  ABC transporter related  35.1 
 
 
436 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  38.81 
 
 
711 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1417  ABC transporter, ATP-binding protein  41.09 
 
 
411 aa  166  5e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  44 
 
 
472 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>