More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7633 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7633  ABC transporter related  100 
 
 		 331 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.130208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 393 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 393 aa  215  8e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1550  ABC transporter related  41 
 
 		 242 aa  209  6e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  41.34 
 
 		 450 aa  208  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  40.39 
 
 		 424 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  43.8 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  43.39 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  40.86 
 
 		 427 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  40.15 
 
 		 422 aa  199  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0053  ABC transporter related  39.43 
 
 		 244 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  46.63 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  39.92 
 
 		 423 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  43.24 
 
 		 421 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  43.11 
 
 		 418 aa  196  7e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2586  ABC transporter related protein  41.41 
 
 		 286 aa  195  9e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  40.21 
 
 		 816 aa  195  9e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  41.63 
 
 		 433 aa  194  1e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1845  ABC transporter related  41.54 
 
 		 288 aa  194  1e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.507693  normal  0.194612 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  39.39 
 
 		 400 aa  193  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0717  ABC transporter related  40.56 
 
 		 464 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  41.89 
 
 		 493 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0371  putative ABC-2 type transport system ATP-binding protein  42.67 
 
 		 410 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  41.98 
 
 		 420 aa  192  8e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  41.94 
 
 		 424 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2409  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 415 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  40.99 
 
 		 419 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0859  ABC transporter related protein  44.49 
 
 		 271 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  42.48 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  39.85 
 
 		 488 aa  191  2e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  40.52 
 
 		 870 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2549  efflux ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.51 
 
 		 415 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.935109  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1474  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 		 469 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.509315  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  44.2 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0191  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 250 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.903738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  39.42 
 
 		 649 aa  189  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  36.15 
 
 		 438 aa  189  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  40.37 
 
 		 419 aa  189  4e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  41.3 
 
 		 468 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  43.39 
 
 		 429 aa  189  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0731  ABC transporter, ATPase subunit  39.67 
 
 		 270 aa  189  7e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.461504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3099  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.56935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3159  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 469 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3136  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.28076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3313  ABC transporter-like protein  40.4 
 
 		 290 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  39.85 
 
 		 420 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0928  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 471 aa  187  1e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  44.55 
 
 		 409 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2758  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00103163  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1985  polysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0805636  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  42.5 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  38.46 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1847  putative lipopolysaccharide ABC transporter, ATP-binding protein  39.41 
 
 		 465 aa  187  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0556444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  42.79 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.89 
 
 		 417 aa  186  4e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.64 
 
 		 454 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  37.29 
 
 		 443 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  41.07 
 
 		 432 aa  186  5e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.4 
 
 		 474 aa  186  6e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  40.55 
 
 		 428 aa  185  7e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  42.48 
 
 		 439 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  40.4 
 
 		 474 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8936  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component-like protein  41.63 
 
 		 284 aa  185  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  40.54 
 
 		 415 aa  185  9e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40.66 
 
 		 407 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  45.45 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  43.12 
 
 		 422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0816  ABC transporter related  40.52 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.067607  normal  0.131733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  38.52 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  45.59 
 
 		 418 aa  183  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  41.78 
 
 		 429 aa  182  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4965  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.09 
 
 		 549 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174676  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  44.83 
 
 		 456 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26450  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  41.73 
 
 		 287 aa  182  8.000000000000001e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3895  ABC transporter related  37.65 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  44.83 
 
 		 429 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3798  ABC O-antigen/lipopolysaccharide exporter, ATPase subunit  36.27 
 
 		 448 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  44.55 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 431 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0822  lipopolysaccharide/O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein  39.48 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0718  polysaccharide export ATP-binding protein  39.48 
 
 		 258 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4003  ABC transporter related  39.15 
 
 		 457 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.584674  normal  0.718876 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2046  ABC transporter related  38.17 
 
 		 605 aa  179  4e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.985083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  41.63 
 
 		 266 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4590  ABC transporter related  39.44 
 
 		 416 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.10294  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  38.71 
 
 		 435 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0848  polysaccharide ABC transporter, ATPase component  35.82 
 
 		 418 aa  179  5.999999999999999e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.105464  normal  0.234564 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1888  ABC transporter related  37.3 
 
 		 247 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1862  ABC transporter related  37.3 
 
 		 247 aa  179  7e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5360  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 549 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5118  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 549 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5510  teichoic acids export protein ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 549 aa  178  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0796349  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  43.56 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  42.79 
 
 		 429 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3546  ABC transporter related  36.11 
 
 		 247 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  40.57 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  41.59 
 
 		 446 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  39.68 
 
 		 449 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  40.57 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>