More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0093 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0093  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 406 aa  815    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0326  ABC transporter related  38.96 
 
 		 430 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.702087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0293  ABC transporter related  45.27 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0293  ABC transporter related  45.27 
 
 		 397 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3883  ABC transporter related  36.19 
 
 		 435 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3931  ABC transporter related  35.25 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.28105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0625  carbohydrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.6 
 
 		 417 aa  208  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4904  ABC transporter-like protein protein  41.13 
 
 		 418 aa  207  2e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4203  ABC transporter related  34.06 
 
 		 429 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3643  ABC transporter related  49.02 
 
 		 443 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000162695  decreased coverage  0.0000834131 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2313  ABC transporter related  44.98 
 
 		 450 aa  205  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0239499 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0650  ABC transporter related  39.94 
 
 		 409 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5771  ABC transporter related  38.82 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4245  ABC transporter related  34.73 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1587  ABC transporter related  38.15 
 
 		 427 aa  203  5e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0851  ATPase  37.46 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4204  ABC transporter related  45.49 
 
 		 424 aa  202  7e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.257703 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2759  ABC transporter related  38.82 
 
 		 428 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.237153  hitchhiker  0.00117132 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2802  ABC transporter related protein  49.51 
 
 		 439 aa  202  9e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4136  ABC transporter related  42.31 
 
 		 468 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000582944 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1647  ABC transporter related  48.58 
 
 		 422 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0858  ABC transporter related  40.24 
 
 		 407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.166623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0264  ABC transporter, ATP-binding protein  33.42 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2770  ABC transporter related  39.29 
 
 		 418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.906203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4940  ABC transporter related  34.84 
 
 		 429 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.18828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0255  teichoic acid translocation ATP-binding protein  33.15 
 
 		 390 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3355  ABC transporter related  43.46 
 
 		 429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1760  ABC transporter related  45.37 
 
 		 415 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0451  ABC transporter related  37.94 
 
 		 422 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15970  ABC transporter, ATP binding component  46.97 
 
 		 447 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1557  ABC transporter related  47.5 
 
 		 422 aa  196  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1505  ABC transporter, ATP-binding protein  34.09 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.334414  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1033  ABC transporter related  36.73 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2372  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 411 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041258 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1102  ABC transporter related  33.42 
 
 		 431 aa  194  3e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2895  ATPase  45.07 
 
 		 369 aa  194  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3088  ABC transporter related  45.1 
 
 		 428 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.204093  normal  0.388179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3354  ABC transporter related  44.98 
 
 		 411 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3694  ABC transporter related  45.05 
 
 		 429 aa  193  5e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1228  ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 416 aa  192  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4089  ABC transporter related  47.03 
 
 		 870 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.591422  normal  0.870036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2398  ABC transporter related  44.55 
 
 		 488 aa  192  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.113996  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0407  ABC transporter related  35.56 
 
 		 439 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.565594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1725  ABC transporter related  42.29 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.047923 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5891  ABC transporter related  39.46 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2174  ABC transporter related  37.55 
 
 		 420 aa  189  8e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.108509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2426  ABC transporter related  37.54 
 
 		 427 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4048  ABC transporter-like  44.12 
 
 		 438 aa  188  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192199  normal  0.366163 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1362  ABC transporter related  40.29 
 
 		 472 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0452028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0421  ABC transporter related  36.99 
 
 		 424 aa  188  2e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2757  ABC transporter related  35.47 
 
 		 408 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3246  ABC transporter related  42.26 
 
 		 435 aa  186  5e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.224686  normal  0.539755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3133  ABC transporter related  40.72 
 
 		 423 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4318  ABC transporter related  35.84 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.976448 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2580  ABC transporter related protein  36.59 
 
 		 428 aa  186  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.652068  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1075  O-antigen ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.06 
 
 		 454 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.164394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2358  ABC transporter related  33.42 
 
 		 421 aa  186  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0723  ABC transporter related  39.19 
 
 		 420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.643849  normal  0.703025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4620  ABC transporter related  34.67 
 
 		 411 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1406  ABC transporter related  44.02 
 
 		 254 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.383526  normal  0.305676 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3925  ABC transporter related  43.54 
 
 		 449 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.466767 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3196  ABC transporter related  43.27 
 
 		 433 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2026  ABC transporter related  40.34 
 
 		 420 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.476742  hitchhiker  0.0046378 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2702  ABC transporter related  33.77 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0066609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2772  ABC transporter related  31.34 
 
 		 419 aa  182  7e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357847  normal  0.420365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0886  ABC transporter related  44.79 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1244  ATPase  42.25 
 
 		 432 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000485389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1398  ABC transporter-related protein  48.56 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00437719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2461  ABC transporter, ATPase subunit  48.56 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00443651  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07245  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 		 433 aa  181  2e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2107  ABC transporter related  39.38 
 
 		 437 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1494  ABC transporter related  48.56 
 
 		 254 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356774  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3032  ABC transporter related  39.35 
 
 		 478 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0673  ABC transporter related  47.06 
 
 		 412 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00619068  hitchhiker  0.000755206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4465  ABC transporter related  41.67 
 
 		 649 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1314  ABC transporter related  44.78 
 
 		 424 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.471926  normal  0.0317706 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2515  ABC transporter related  34.81 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.780644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2571  ABC transporter related protein  38.21 
 
 		 419 aa  180  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00120547  normal  0.533864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0276  ABC transporter related  47.06 
 
 		 392 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0325  ABC transporter related  38.52 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123997  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1404  ABC transporter related  42.61 
 
 		 266 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1387  ABC transporter related  31.71 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.928113  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0814  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  44.97 
 
 		 474 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3976  ABC polysaccharide/polyol phosphate export pump, ATPase subunit  43.98 
 
 		 435 aa  179  9e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.421912 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0838  ABC transporter of LPS O-antigen, Wzt  44.97 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5685  ABC transporter-like  33.73 
 
 		 416 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0795174  normal  0.634912 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0564  ABC transporter related  40.53 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2463  ABC transporter related protein  43.63 
 
 		 431 aa  177  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424211  normal  0.554177 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1747  ABC transporter related  37.58 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0651  ABC polysaccharide efflux pump, ATPase subunit  37.81 
 
 		 472 aa  177  4e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.601465  normal  0.274396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2537  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  39.53 
 
 		 261 aa  176  5e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.481808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6240  ABC subunit of A-band LPS efflux transporter  37.08 
 
 		 421 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20820  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system, ATPase component  43.61 
 
 		 256 aa  176  6e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270137  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0545  ABC transporter related  41.18 
 
 		 816 aa  176  8e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.4863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  41.12 
 
 		 711 aa  176  9e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1675  ABC transporter related  46.77 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1574  polysaccharide/polyol phosphate ABC transporter ATPase  37.64 
 
 		 422 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.801511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0267  ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0258  teichoic acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.38 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.591721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0955  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 594 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>