More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2424 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  70.59 
 
 		 475 aa  657    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 467 aa  934    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  70.38 
 
 		 475 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  56.32 
 
 		 3954 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  51.79 
 
 		 727 aa  167  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.37 
 
 		 2954 aa  167  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  47.31 
 
 		 3209 aa  163  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.37 
 
 		 1415 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.69 
 
 		 907 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  47.2 
 
 		 820 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  53.25 
 
 		 1029 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  53.25 
 
 		 1029 aa  143  8e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.72 
 
 		 1197 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  45.69 
 
 		 824 aa  139  8.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.65 
 
 		 4334 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  42.28 
 
 		 260 aa  136  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  43.12 
 
 		 1019 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3154  hemolysin-type calcium-binding region  40.32 
 
 		 202 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0996816 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3509  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  40.32 
 
 		 202 aa  133  6e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  36.24 
 
 		 1712 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  36.05 
 
 		 2775 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  43.98 
 
 		 3608 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.96 
 
 		 1236 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  38.8 
 
 		 2467 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  43.52 
 
 		 1055 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  43.65 
 
 		 2133 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.69 
 
 		 2667 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  36.36 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  35.02 
 
 		 2807 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  46.28 
 
 		 3619 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  35.79 
 
 		 1764 aa  123  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.93 
 
 		 2105 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  46.28 
 
 		 3619 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.84 
 
 		 1795 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  35.4 
 
 		 686 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  39.61 
 
 		 980 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  43.68 
 
 		 395 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  37.23 
 
 		 1855 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  39.04 
 
 		 615 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  39.62 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  38.94 
 
 		 2885 aa  117  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.35 
 
 		 813 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  40 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  37.82 
 
 		 1079 aa  117  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  47.5 
 
 		 3026 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  41.59 
 
 		 768 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  40.45 
 
 		 574 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  34.45 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  40.79 
 
 		 2198 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  36.64 
 
 		 757 aa  113  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  36.55 
 
 		 2668 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8151  CHRD domain containing protein  41.15 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.159577  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  49.28 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.8 
 
 		 588 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  38.86 
 
 		 503 aa  110  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  33.44 
 
 		 851 aa  108  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  37.27 
 
 		 2701 aa  108  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  42.22 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  48.57 
 
 		 614 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  35.95 
 
 		 219 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  33.01 
 
 		 313 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  35.9 
 
 		 1133 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  39.22 
 
 		 2097 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  38.03 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  38.67 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.54 
 
 		 1016 aa  102  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.36 
 
 		 1557 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  35.71 
 
 		 245 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  41.2 
 
 		 2950 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  34.71 
 
 		 1134 aa  102  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  40.89 
 
 		 1650 aa  101  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  34.15 
 
 		 219 aa  101  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  43.17 
 
 		 946 aa  101  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  32.81 
 
 		 313 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  45.14 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  35.99 
 
 		 1895 aa  100  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  48.84 
 
 		 1582 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  42.7 
 
 		 1610 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  42.54 
 
 		 1164 aa  99.8  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  38.12 
 
 		 546 aa  97.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 709 aa  97.1  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1854  hemolysin-type calcium-binding region  38.01 
 
 		 5171 aa  96.3  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000611986 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.36 
 
 		 855 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.81 
 
 		 1963 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  35.92 
 
 		 1480 aa  95.1  3e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 9867 aa  94.4  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.91 
 
 		 5839 aa  94  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  34.4 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  36.99 
 
 		 621 aa  94  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.65 
 
 		 3427 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  33.02 
 
 		 1499 aa  93.2  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  30.74 
 
 		 465 aa  93.6  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  49.59 
 
 		 4106 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  37.56 
 
 		 1383 aa  92.8  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.1 
 
 		 1424 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  31.8 
 
 		 582 aa  91.3  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  36.12 
 
 		 589 aa  91.3  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0387  cadherin  37.88 
 
 		 938 aa  91.7  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>