More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1944 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1249    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1687  putative calcium binding protein  36.39 
 
 		 463 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.921338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3567  hypothetical protein  35.21 
 
 		 1798 aa  209  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.621176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  41.52 
 
 		 574 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  42.79 
 
 		 546 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  39.35 
 
 		 1029 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.35 
 
 		 1029 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  40.58 
 
 		 395 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.37 
 
 		 1415 aa  118  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  37.05 
 
 		 395 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  43.5 
 
 		 540 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  43.5 
 
 		 540 aa  112  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  35.77 
 
 		 1019 aa  107  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  42.44 
 
 		 357 aa  106  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  46.21 
 
 		 768 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  39.53 
 
 		 3209 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  38.79 
 
 		 486 aa  104  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.69 
 
 		 1055 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  41.67 
 
 		 1764 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  34.09 
 
 		 614 aa  96.3  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4622  cellulase  28.33 
 
 		 870 aa  95.5  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 448 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  45.8 
 
 		 3954 aa  94.7  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  35.48 
 
 		 531 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  36.99 
 
 		 467 aa  93.6  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  45.76 
 
 		 2950 aa  93.6  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  47.83 
 
 		 824 aa  93.2  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  38.01 
 
 		 2701 aa  92.8  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  28.62 
 
 		 2133 aa  91.7  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  48.31 
 
 		 3608 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2500  hypothetical protein  39.73 
 
 		 462 aa  92  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.967827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  36.98 
 
 		 475 aa  90.9  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  35.26 
 
 		 2954 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0963  hypothetical protein  29.44 
 
 		 448 aa  90.1  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.733506 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 		 4334 aa  89.7  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  45.74 
 
 		 475 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 2198 aa  87.8  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0530  hypothetical protein  37.97 
 
 		 448 aa  87.8  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  34.72 
 
 		 535 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  45.38 
 
 		 2467 aa  87  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 503 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.48 
 
 		 588 aa  86.7  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  40.97 
 
 		 3619 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  40.56 
 
 		 3619 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  42.22 
 
 		 1112 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6876  Hemolysin-type calcium-binding region  34.87 
 
 		 547 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  38.41 
 
 		 535 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  34.36 
 
 		 503 aa  84  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  42.65 
 
 		 851 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  40.6 
 
 		 1197 aa  83.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  43.62 
 
 		 1855 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6094  hypothetical protein  26.68 
 
 		 417 aa  82.4  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.44 
 
 		 2346 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  30.49 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6850  Hemolysin-type calcium-binding region  41.35 
 
 		 565 aa  80.5  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  34.55 
 
 		 727 aa  80.5  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  41.25 
 
 		 2097 aa  80.5  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  30.88 
 
 		 907 aa  80.1  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  39.69 
 
 		 2567 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  41.13 
 
 		 2807 aa  79.3  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1741  Hemolysin-type calcium-binding region  49.11 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1717  Hemolysin-type calcium-binding region  49.11 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  31.9 
 
 		 1072 aa  78.2  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.95 
 
 		 2678 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  46.55 
 
 		 1582 aa  77.8  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  50 
 
 		 8682 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.42 
 
 		 1883 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  34.93 
 
 		 1134 aa  77.4  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  32.9 
 
 		 462 aa  77  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 1610 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.24 
 
 		 1180 aa  76.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  48.84 
 
 		 9030 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  45.74 
 
 		 5218 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0190  hypothetical protein  24.09 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.17 
 
 		 5962 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  34.78 
 
 		 917 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 		 1372 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  42.14 
 
 		 1610 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1877  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1699 aa  73.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.070874 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  44.07 
 
 		 820 aa  73.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2055  hemolysin-type calcium-binding region  34.92 
 
 		 652 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.660296 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.78 
 
 		 556 aa  72.4  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3408  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.87 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.230394 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  41.38 
 
 		 1145 aa  72  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  37.5 
 
 		 3026 aa  71.2  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5023  multicopper oxidase, type 2  35.29 
 
 		 1346 aa  71.2  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.805273  normal  0.733827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  34.5 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  34.46 
 
 		 313 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  32.4 
 
 		 1037 aa  70.1  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  43.4 
 
 		 1650 aa  70.1  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  34.46 
 
 		 313 aa  69.3  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  47.67 
 
 		 6753 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.14 
 
 		 3427 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05070  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  42.11 
 
 		 4106 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2705  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  41 
 
 		 517 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0718596 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1998  Hemolysin-type calcium-binding region  41.82 
 
 		 817 aa  68.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0671214 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  35.51 
 
 		 1287 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2816  hemolysin-type calcium-binding region  30.58 
 
 		 351 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  38.57 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  42.34 
 
 		 1112 aa  67.4  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>