More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2112 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  73.24 
 
 
481 aa  717    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  100 
 
 
478 aa  965    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  68.28 
 
 
476 aa  659    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  66.39 
 
 
474 aa  650    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  66.52 
 
 
480 aa  621  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  65.19 
 
 
504 aa  619  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  56.34 
 
 
490 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  56.01 
 
 
486 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  54.05 
 
 
476 aa  482  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  51.97 
 
 
479 aa  478  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  53.44 
 
 
475 aa  475  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  52.59 
 
 
479 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  52.8 
 
 
468 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  46.6 
 
 
444 aa  331  2e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  46.6 
 
 
442 aa  330  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  46.6 
 
 
444 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  39.91 
 
 
727 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  39.5 
 
 
1631 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  39.58 
 
 
785 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  33.11 
 
 
451 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  40.96 
 
 
1134 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  36.08 
 
 
614 aa  150  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  38.72 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  38.72 
 
 
531 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  37.64 
 
 
820 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.76 
 
 
648 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  35.64 
 
 
1133 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  32.75 
 
 
513 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  33.24 
 
 
745 aa  140  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  36.88 
 
 
535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  35.46 
 
 
535 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  33.99 
 
 
606 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  40.99 
 
 
713 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  40.54 
 
 
713 aa  111  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  33.56 
 
 
641 aa  107  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0100  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.95 
 
 
928 aa  103  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  28.81 
 
 
1112 aa  96.7  9e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20991  hypothetical protein  29.6 
 
 
486 aa  92  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  43.57 
 
 
2467 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.5 
 
 
768 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  33.33 
 
 
1112 aa  90.5  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  36.49 
 
 
486 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  37.13 
 
 
1037 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  38.41 
 
 
2133 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  41.67 
 
 
2701 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  38.41 
 
 
2198 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51200  Secreted mannuronan C-5 epimerase  43.48 
 
 
553 aa  76.6  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0384  hypothetical protein  46.61 
 
 
4285 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2553  Hemolysin-type calcium-binding region  32.52 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49400  Secreted mannuronan C5-epimerase-like protein  56.96 
 
 
532 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49360  hypothetical protein  48.84 
 
 
901 aa  74.3  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  39.19 
 
 
768 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  52.33 
 
 
1610 aa  74.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4317  RTX toxin, putative  46.6 
 
 
2768 aa  73.6  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  47.73 
 
 
515 aa  73.6  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51250  Secreted bifunctional mannuronan C-5 epimerase/alginate lyase  40.6 
 
 
856 aa  73.2  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  48 
 
 
1610 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3808  outer membrane adhesin like proteiin  43.1 
 
 
2524 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000355585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51190  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.67 
 
 
1403 aa  72.8  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.156968  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0084  Hemolysin-type calcium-binding region  46.53 
 
 
221 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0482149 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49350  hypothetical protein  50.6 
 
 
889 aa  72.4  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 
759 aa  72.4  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1950  FG-GAP repeat-containing protein  29.91 
 
 
861 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  52.17 
 
 
1883 aa  70.1  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1554  Hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 
677 aa  70.1  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00951  hypothetical protein  27.88 
 
 
373 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.139227 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  48.72 
 
 
1019 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  46.15 
 
 
686 aa  68.6  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  35.26 
 
 
2097 aa  68.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.43 
 
 
2678 aa  68.2  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4367  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.74 
 
 
1269 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0060  peptidase, metallopeptidase  30.63 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.210793  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4429  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.74 
 
 
1269 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.332356 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  27.64 
 
 
1202 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4655  hemolysin-type calcium-binding region  46.51 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51170  Secreted mannuronan C-5 epimerase  44.14 
 
 
1839 aa  67  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13810  Alginate lyase  41.46 
 
 
417 aa  66.6  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40 
 
 
1180 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  50 
 
 
1394 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  52.86 
 
 
556 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42310  hypothetical protein  46.67 
 
 
858 aa  65.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.809887  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  46.67 
 
 
16322 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  38.21 
 
 
917 aa  65.9  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0384  putative outer membrane adhesin like protein  45.19 
 
 
5442 aa  65.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  46.67 
 
 
1168 aa  64.7  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  41.67 
 
 
2743 aa  64.7  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0800  Hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 
621 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  39.67 
 
 
813 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  46.15 
 
 
998 aa  64.3  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  52.56 
 
 
907 aa  64.7  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.02 
 
 
5839 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.33 
 
 
656 aa  64.3  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5874  Hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 
621 aa  64.3  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132218  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  38.24 
 
 
362 aa  63.9  0.000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51230  Secreted mannuronan C-5 epimerase  33.33 
 
 
874 aa  63.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  51.52 
 
 
1390 aa  63.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3258  putative outer membrane adhesin like protein  43.69 
 
 
4214 aa  63.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.523735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25821  hypothetical protein  38.1 
 
 
1111 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  28.09 
 
 
681 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  60.78 
 
 
1286 aa  62.4  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>