40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1227 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  100 
 
 
1037 aa  1955    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  38.55 
 
 
2178 aa  246  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  56.22 
 
 
615 aa  222  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0490  surface array protein  28.41 
 
 
1292 aa  105  4e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.799434  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0456  surface array protein  28.52 
 
 
1164 aa  104  7e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182741  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  28.96 
 
 
459 aa  102  4e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  27.05 
 
 
458 aa  99.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0478  surface layer protein SapA12  28.19 
 
 
1109 aa  87.4  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0464  surface array protein  29 
 
 
1257 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0462  surface array protein  28.19 
 
 
1106 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0486  surface array protein  28.19 
 
 
1106 aa  87  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.2 
 
 
862 aa  67.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  33.98 
 
 
1121 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  39.13 
 
 
1108 aa  64.7  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  40.43 
 
 
502 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  39.36 
 
 
464 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  39.36 
 
 
559 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  39.58 
 
 
595 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  31.78 
 
 
362 aa  61.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  39.36 
 
 
485 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  38.14 
 
 
467 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  37.93 
 
 
595 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  32.98 
 
 
1543 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  35.96 
 
 
700 aa  55.1  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1392  alkaline phosphatase  28.76 
 
 
1355 aa  53.9  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.127583  normal  0.479839 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  34.52 
 
 
613 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  40.23 
 
 
564 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  30.42 
 
 
830 aa  53.5  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  32.98 
 
 
1821 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  36.56 
 
 
580 aa  52  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  30.85 
 
 
1584 aa  51.6  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  32.58 
 
 
451 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  34.41 
 
 
104 aa  49.3  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  33.67 
 
 
524 aa  48.5  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  34.57 
 
 
392 aa  48.1  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  25.16 
 
 
941 aa  47.8  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  26.49 
 
 
939 aa  47.4  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  24.28 
 
 
921 aa  45.4  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  30.23 
 
 
768 aa  45.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  31.31 
 
 
363 aa  45.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>