35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0744 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  100 
 
 
613 aa  1243    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  50.33 
 
 
700 aa  534  1e-150  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  64.92 
 
 
1584 aa  266  1e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  62.05 
 
 
1821 aa  261  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  62.05 
 
 
1543 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  51.98 
 
 
580 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  55.8 
 
 
451 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  56.91 
 
 
564 aa  218  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  58.01 
 
 
1108 aa  216  8e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  56.32 
 
 
502 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  46.98 
 
 
559 aa  203  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  49.76 
 
 
621 aa  203  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  51.6 
 
 
595 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  51.6 
 
 
595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  53.85 
 
 
363 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  50.54 
 
 
464 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  50.54 
 
 
485 aa  196  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  53.3 
 
 
467 aa  195  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  38.72 
 
 
392 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  46.96 
 
 
193 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  37.25 
 
 
393 aa  170  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  59.6 
 
 
104 aa  123  8e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  68.35 
 
 
80 aa  117  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  42.16 
 
 
524 aa  89  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  47.3 
 
 
615 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  32.17 
 
 
785 aa  77.4  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.41 
 
 
862 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  32.14 
 
 
681 aa  65.1  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  31.48 
 
 
1121 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  29.82 
 
 
2178 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  34.52 
 
 
1037 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  31.76 
 
 
480 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 
484 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  30.09 
 
 
768 aa  47.8  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  31.33 
 
 
482 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>