38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1391 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  100 
 
 
559 aa  1146    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  78.65 
 
 
502 aa  293  5e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  79.41 
 
 
464 aa  282  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  79.41 
 
 
485 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  65.14 
 
 
467 aa  240  5e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  67.82 
 
 
564 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  71.7 
 
 
580 aa  232  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  57.69 
 
 
451 aa  229  1e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  60.56 
 
 
595 aa  225  2e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  60 
 
 
595 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  61.02 
 
 
363 aa  221  3e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  60.45 
 
 
1108 aa  211  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  65.22 
 
 
621 aa  208  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  59.43 
 
 
1821 aa  205  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  59.2 
 
 
1584 aa  203  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  46.98 
 
 
613 aa  202  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  59.09 
 
 
1543 aa  201  3e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  42.91 
 
 
700 aa  199  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  56.13 
 
 
193 aa  161  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  44.64 
 
 
392 aa  150  6e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  40.94 
 
 
393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  59.6 
 
 
104 aa  128  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  69.62 
 
 
80 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  41.75 
 
 
524 aa  80.1  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  50.67 
 
 
615 aa  72.4  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  33.11 
 
 
785 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  33.93 
 
 
681 aa  67.8  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 
862 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  33.93 
 
 
1121 aa  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 
484 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  39.36 
 
 
1037 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  36.78 
 
 
2178 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  36.14 
 
 
480 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  30 
 
 
768 aa  53.5  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  32.29 
 
 
459 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  32.14 
 
 
482 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  30.1 
 
 
2911 aa  47.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20941  hypothetical protein  29.89 
 
 
458 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>