84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1794 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  917    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  64.95 
 
 		 482 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  58.28 
 
 		 484 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  30.6 
 
 		 524 aa  88.6  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  28.15 
 
 		 681 aa  66.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  27.55 
 
 		 785 aa  60.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  26.5 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  46.75 
 
 		 744 aa  57.8  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  36.14 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  36.14 
 
 		 559 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  36.14 
 
 		 502 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  36.19 
 
 		 2667 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  36.14 
 
 		 485 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  26.02 
 
 		 1757 aa  54.3  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  35.64 
 
 		 564 aa  54.3  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.36 
 
 		 1236 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  35.92 
 
 		 1764 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  38.82 
 
 		 739 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  37 
 
 		 1121 aa  53.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  32.38 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  23.8 
 
 		 595 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  26.44 
 
 		 580 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  25.63 
 
 		 615 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  27.45 
 
 		 392 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  23.64 
 
 		 595 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  29.95 
 
 		 1424 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.63 
 
 		 862 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  37.08 
 
 		 1175 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  31.4 
 
 		 613 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  31 
 
 		 467 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  29.91 
 
 		 2296 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  38.3 
 
 		 709 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.89 
 
 		 2885 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  35.92 
 
 		 657 aa  49.3  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  32.56 
 
 		 700 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  33.94 
 
 		 736 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  33.73 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.89 
 
 		 2245 aa  48.1  0.0004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 		 741 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  41.18 
 
 		 7679 aa  47.4  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  34.29 
 
 		 734 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  34.04 
 
 		 1037 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  30.41 
 
 		 425 aa  47.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  34.38 
 
 		 219 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1128  hypothetical protein  30.77 
 
 		 362 aa  47  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  45.83 
 
 		 2329 aa  47  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  32.86 
 
 		 2178 aa  47  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.03 
 
 		 3209 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 491 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  39.33 
 
 		 692 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1543 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  27.98 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  36.54 
 
 		 1286 aa  46.6  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.33 
 
 		 1712 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.04 
 
 		 4334 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2029  Hemolysin-type calcium-binding region  49.15 
 
 		 148 aa  45.8  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000343337  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  40.23 
 
 		 2704 aa  45.8  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  31.25 
 
 		 1805 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  30.61 
 
 		 1821 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  36.36 
 
 		 795 aa  45.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  31.25 
 
 		 3587 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25851  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1121 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1584 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  33.33 
 
 		 621 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2409  hypothetical protein  38.38 
 
 		 15831 aa  45.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1049  hemolysin-type calcium-binding region  40.68 
 
 		 370 aa  45.1  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.416377  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 3427 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3070  hypothetical protein  32.65 
 
 		 484 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  39.73 
 
 		 451 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  39.29 
 
 		 3587 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  40.3 
 
 		 781 aa  44.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  27.42 
 
 		 363 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.66 
 
 		 868 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  40 
 
 		 4798 aa  44.3  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1054  hypothetical protein  30.48 
 
 		 527 aa  44.3  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  40.26 
 
 		 769 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  32.67 
 
 		 574 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 		 260 aa  43.9  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  44.26 
 
 		 3094 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.64 
 
 		 3598 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  28.98 
 
 		 518 aa  43.5  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  36.9 
 
 		 245 aa  43.1  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  46.88 
 
 		 4687 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>