109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1403 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 482 aa  931    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  65.78 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  59.84 
 
 		 484 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  27.71 
 
 		 524 aa  79.3  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  28.1 
 
 		 785 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  28.46 
 
 		 681 aa  70.1  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  27.15 
 
 		 595 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  26.55 
 
 		 768 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  27.65 
 
 		 1757 aa  59.7  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  39.09 
 
 		 744 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  36.26 
 
 		 621 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.77 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  33.87 
 
 		 1764 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.21 
 
 		 2885 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  45.16 
 
 		 2667 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.39 
 
 		 862 aa  53.5  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  25 
 
 		 615 aa  52.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  39.53 
 
 		 1121 aa  52.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  38.82 
 
 		 1108 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  43.4 
 
 		 1236 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  39.58 
 
 		 515 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  35.19 
 
 		 1175 aa  51.2  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  44 
 
 		 620 aa  50.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  35.71 
 
 		 564 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  27.22 
 
 		 3427 aa  50.8  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  29.03 
 
 		 3209 aa  50.1  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1424 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  38.78 
 
 		 782 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  23.27 
 
 		 1821 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 		 518 aa  49.3  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  25.16 
 
 		 1805 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.29 
 
 		 5839 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  23.89 
 
 		 1584 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  32.11 
 
 		 2245 aa  48.5  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3070  hypothetical protein  33.33 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  32.14 
 
 		 464 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.96 
 
 		 1963 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  32.14 
 
 		 502 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  30.61 
 
 		 485 aa  47.8  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  32.14 
 
 		 559 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  32.99 
 
 		 574 aa  48.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  27.97 
 
 		 580 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  31.54 
 
 		 4798 aa  47.4  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  29.13 
 
 		 2182 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 245 aa  47.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1543 aa  47  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4558  hemolysin-type calcium-binding region  30.88 
 
 		 781 aa  47  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0372374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.31 
 
 		 980 aa  47  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  41.27 
 
 		 657 aa  47  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  40 
 
 		 559 aa  47  0.0008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 		 477 aa  47  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  42.47 
 
 		 1534 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  37.65 
 
 		 572 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2300  hypothetical protein  34.07 
 
 		 739 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.259939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  38.82 
 
 		 950 aa  46.6  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1049  hemolysin-type calcium-binding region  41.38 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.416377  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  34.13 
 
 		 539 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  46.67 
 
 		 260 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  53.06 
 
 		 2911 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  36.36 
 
 		 1112 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.1 
 
 		 867 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  37.97 
 
 		 639 aa  45.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  45.31 
 
 		 4334 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.86 
 
 		 1279 aa  45.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  35.62 
 
 		 1499 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  39.51 
 
 		 1883 aa  45.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  41.1 
 
 		 769 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  32.31 
 
 		 491 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  33.86 
 
 		 736 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  35.9 
 
 		 734 aa  45.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  33.14 
 
 		 942 aa  44.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  31.33 
 
 		 613 aa  44.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3160  hemolysin-type calcium-binding region  45.33 
 
 		 523 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.243046 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  37.21 
 
 		 36805 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  31.37 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  45.45 
 
 		 1112 aa  44.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.62 
 
 		 5962 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0193  hypothetical protein  25.93 
 
 		 368 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  42.5 
 
 		 1582 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1219  putative ABC-type polysaccharide/polyol phosphate transport system ATPase component  25 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.179515  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0533  hemolysin-type calcium-binding region  37.18 
 
 		 359 aa  44.3  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.695548  normal  0.505891 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  41.67 
 
 		 9030 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5172  hemolysin-type calcium-binding region  32.38 
 
 		 516 aa  44.3  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.484438  normal  0.743168 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  47.89 
 
 		 959 aa  44.3  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.17 
 
 		 1855 aa  44.3  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  34.75 
 
 		 2775 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0055  putative hemagglutinin/hemolysin-related protein  41.03 
 
 		 3314 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  31.45 
 
 		 729 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.03 
 
 		 2239 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1361  hypothetical protein  42.27 
 
 		 2329 aa  43.9  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0713283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  34.62 
 
 		 741 aa  43.9  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  41.67 
 
 		 6753 aa  43.9  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  37.36 
 
 		 928 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  33.67 
 
 		 3587 aa  43.9  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  29.08 
 
 		 425 aa  43.9  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 		 1286 aa  43.9  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  27.45 
 
 		 2178 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1059  RTX protein  41.25 
 
 		 2648 aa  43.9  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  33.67 
 
 		 3587 aa  43.9  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>