127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0931 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 
484 aa  926    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  58.73 
 
 
482 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  58.49 
 
 
480 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  31.17 
 
 
524 aa  106  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  29.84 
 
 
785 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  30.67 
 
 
681 aa  75.9  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  26.52 
 
 
768 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  29.86 
 
 
1757 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.4 
 
 
464 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.06 
 
 
862 aa  62.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  35.45 
 
 
559 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  35.4 
 
 
502 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  35.4 
 
 
485 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  31.97 
 
 
1108 aa  60.5  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  36.27 
 
 
621 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  24.75 
 
 
580 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  26.15 
 
 
595 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  38.32 
 
 
744 aa  56.2  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1260  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.24 
 
 
477 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3070  hypothetical protein  31.67 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  41.51 
 
 
2667 aa  55.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  35.35 
 
 
574 aa  54.3  0.000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
1175 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  26.44 
 
 
595 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4562  hemolysin-type calcium-binding region  36.43 
 
 
245 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  22.4 
 
 
1821 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  23.95 
 
 
1543 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  46.15 
 
 
1079 aa  53.5  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  23.2 
 
 
615 aa  53.5  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  36.72 
 
 
2885 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  33.33 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0382  putative outer membrane adhesin like proteiin  51.85 
 
 
5839 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  25 
 
 
1584 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  35 
 
 
564 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  42.17 
 
 
1236 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  31.95 
 
 
1526 aa  50.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  34.78 
 
 
959 aa  50.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  38.95 
 
 
1121 aa  50.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.23 
 
 
795 aa  50.1  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  29.5 
 
 
3598 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  34.78 
 
 
860 aa  49.7  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0193  hypothetical protein  29.7 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69315  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  31.08 
 
 
1043 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  31.54 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  28.43 
 
 
392 aa  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  40.79 
 
 
1286 aa  48.5  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 
4334 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  38.27 
 
 
1764 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  37.01 
 
 
2178 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_003296  RS03668  putative hemolysin-type protein  40.45 
 
 
692 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  32.69 
 
 
613 aa  47.8  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.03 
 
 
1795 aa  47.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0230  hypothetical protein  36.46 
 
 
657 aa  47.8  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.924729  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3709  hemolysin-type calcium-binding region  42.25 
 
 
2704 aa  47.8  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.406778 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  36.84 
 
 
1499 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  32.32 
 
 
451 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  32.69 
 
 
363 aa  47.4  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  34.35 
 
 
1538 aa  47  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  47.62 
 
 
3094 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5076  hypothetical protein  35.25 
 
 
736 aa  47.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  26.86 
 
 
2911 aa  47  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  38.39 
 
 
1582 aa  47  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  32.88 
 
 
1805 aa  47  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  35.23 
 
 
1884 aa  47  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  29.8 
 
 
620 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  33.33 
 
 
700 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  36.21 
 
 
2887 aa  46.6  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  34.19 
 
 
1424 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  46.48 
 
 
734 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  38.36 
 
 
769 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3878  lipase  25.97 
 
 
709 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0292806 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  34.86 
 
 
2133 aa  46.2  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  42.31 
 
 
3587 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  32.82 
 
 
3091 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  38.61 
 
 
3954 aa  46.2  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  30.65 
 
 
559 aa  46.6  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  42.31 
 
 
3587 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  41.11 
 
 
741 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  36.84 
 
 
1883 aa  45.8  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  31.15 
 
 
491 aa  45.8  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  31.67 
 
 
1532 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  38.24 
 
 
589 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6263  hemolysin-type calcium-binding region  43.33 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0113819 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  44.12 
 
 
561 aa  45.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  29.37 
 
 
760 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  41.03 
 
 
686 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.25 
 
 
3619 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0699  structural toxin protein RtxA  38.24 
 
 
7679 aa  45.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.96 
 
 
3209 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  35.58 
 
 
950 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.45 
 
 
2507 aa  45.1  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  41.25 
 
 
3619 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  39.47 
 
 
2784 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  41.25 
 
 
3608 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  48.15 
 
 
5218 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  42.42 
 
 
2567 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  34.85 
 
 
1287 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  38.78 
 
 
2245 aa  44.7  0.004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  33.61 
 
 
768 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>