91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_00841 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  63.6 
 
 
1821 aa  1757    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  61.69 
 
 
1543 aa  1734    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  100 
 
 
1584 aa  3076    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  54.04 
 
 
580 aa  303  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  64.92 
 
 
700 aa  266  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  64.92 
 
 
613 aa  265  4e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  49.28 
 
 
595 aa  259  4e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.84 
 
 
595 aa  258  6e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  21.08 
 
 
1348 aa  228  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  60 
 
 
564 aa  216  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  55 
 
 
502 aa  204  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  53.37 
 
 
1108 aa  203  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  59.2 
 
 
559 aa  204  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  57.69 
 
 
451 aa  202  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  27.02 
 
 
519 aa  199  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  44.49 
 
 
467 aa  197  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  50.75 
 
 
485 aa  195  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  53.59 
 
 
464 aa  195  5e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  25.09 
 
 
1561 aa  189  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  48.22 
 
 
621 aa  185  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  25.62 
 
 
1561 aa  185  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  49.72 
 
 
193 aa  184  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  47.19 
 
 
392 aa  179  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  49.17 
 
 
363 aa  172  6e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  22.89 
 
 
1809 aa  167  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  26.02 
 
 
1578 aa  165  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  41.81 
 
 
393 aa  162  4e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  56.12 
 
 
104 aa  121  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  67.09 
 
 
80 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  27.72 
 
 
996 aa  111  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  25.9 
 
 
785 aa  75.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  38.24 
 
 
524 aa  73.2  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.53 
 
 
2182 aa  70.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.93 
 
 
862 aa  70.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  20.83 
 
 
495 aa  69.7  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  32.48 
 
 
669 aa  69.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 
652 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 
652 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  28.57 
 
 
671 aa  66.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  45.83 
 
 
615 aa  65.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  29.44 
 
 
768 aa  65.1  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1202  triple helix repeat-containing collagen  28.26 
 
 
400 aa  63.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  34.51 
 
 
681 aa  61.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  27.19 
 
 
2178 aa  60.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  36.25 
 
 
574 aa  59.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1027  triple helix repeat-containing collagen  26.97 
 
 
403 aa  57.4  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.155494  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  43.59 
 
 
3954 aa  57.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  40.96 
 
 
688 aa  57.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  31.78 
 
 
2914 aa  56.6  0.000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02973  ice nucleation protein  22.93 
 
 
276 aa  56.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  41.56 
 
 
1424 aa  55.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  32.31 
 
 
656 aa  54.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22180  hypothetical protein  31.58 
 
 
750 aa  54.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.314625  normal  0.946769 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.03 
 
 
3977 aa  53.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  38.1 
 
 
593 aa  53.9  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  42.5 
 
 
928 aa  53.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.86 
 
 
2775 aa  53.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1715  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  25.99 
 
 
473 aa  52.4  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3410  hypothetical protein  28.65 
 
 
316 aa  51.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000374357  hitchhiker  0.0017723 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  27.59 
 
 
767 aa  51.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
932 aa  51.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.35 
 
 
680 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  29 
 
 
1121 aa  52  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  27.59 
 
 
767 aa  51.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  30.85 
 
 
1037 aa  51.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  25 
 
 
484 aa  52  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2406  collagen triple helix repeat protein  29.35 
 
 
300 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  37.35 
 
 
928 aa  50.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4370  triple helix repeat-containing collagen  33.74 
 
 
344 aa  50.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324657  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  20.27 
 
 
429 aa  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  22.93 
 
 
421 aa  49.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  36.36 
 
 
3587 aa  49.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0451  hypothetical protein  36.36 
 
 
682 aa  49.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.935118  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1764 aa  49.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.14 
 
 
1180 aa  49.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  36.96 
 
 
2950 aa  49.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1638  VCBS  31.63 
 
 
5094 aa  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3767  hemolysin-type calcium-binding region  30.25 
 
 
1757 aa  48.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.902425  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0522  RNA-binding S4 domain protein  33.51 
 
 
698 aa  48.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.575781 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  35.96 
 
 
4723 aa  48.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  29.18 
 
 
2313 aa  47.8  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3403  triple helix repeat-containing collagen  32.13 
 
 
582 aa  46.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000154784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  53.33 
 
 
782 aa  46.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2208  ribonuclease, Rne/Rng family protein  36.62 
 
 
1065 aa  45.8  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.162702 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  34.67 
 
 
659 aa  45.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0478  outer membrane adhesin like proteiin  32.35 
 
 
3259 aa  45.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0276  outer membrane adhesin like proteiin  36.17 
 
 
3091 aa  45.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1403  hemolysin-type calcium-binding region  23.89 
 
 
482 aa  45.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1944  hypothetical protein  30.77 
 
 
621 aa  45.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1608  collagen triple helix repeat protein  32.02 
 
 
1101 aa  45.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.712053 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2569  hypothetical protein  34.14 
 
 
442 aa  45.4  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>