19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3090 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  100 
 
 		 519 aa  914    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  39.5 
 
 		 1809 aa  304  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  39.54 
 
 		 1561 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  39.36 
 
 		 1561 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  36.71 
 
 		 1578 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1584 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  23.62 
 
 		 1543 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  35.03 
 
 		 996 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1821 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  30.26 
 
 		 423 aa  66.6  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24577  predicted protein  29.27 
 
 		 1676 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0561517  normal  0.0448283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  34.78 
 
 		 2900 aa  50.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  31.23 
 
 		 1348 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3648  hypothetical protein  24.01 
 
 		 1616 aa  47.4  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  28.26 
 
 		 3521 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5540  hypothetical protein  26.74 
 
 		 368 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.693087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  31.4 
 
 		 3286 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  33.16 
 
 		 2899 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  38.46 
 
 		 2140 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>