22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4068 on replicon NC_009040
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  42.74 
 
 		 1578 aa  716    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  42.76 
 
 		 1809 aa  825    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  98.78 
 
 		 1561 aa  2556    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  100 
 
 		 1561 aa  2592    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  42.54 
 
 		 519 aa  296  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1543 aa  284  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  24.16 
 
 		 1821 aa  252  4e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  27.44 
 
 		 1584 aa  214  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  37.47 
 
 		 996 aa  185  8.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  26.29 
 
 		 1348 aa  96.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  26.56 
 
 		 1483 aa  63.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  27.68 
 
 		 1107 aa  62.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24577  predicted protein  26.71 
 
 		 1676 aa  60.8  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0561517  normal  0.0448283 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  24.94 
 
 		 631 aa  54.7  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5538  hypothetical protein  26.13 
 
 		 819 aa  53.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.981393 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  28.22 
 
 		 1267 aa  52  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  33.1 
 
 		 3521 aa  48.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40672  predicted protein  33.99 
 
 		 1034 aa  48.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  28.26 
 
 		 653 aa  47.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  27.5 
 
 		 969 aa  46.6  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  27.94 
 
 		 868 aa  45.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3717  hypothetical protein  34.48 
 
 		 600 aa  45.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102425  normal  0.276356 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>