94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1754 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  100 
 
 		 1809 aa  3217    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  44.42 
 
 		 1561 aa  841    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  45.22 
 
 		 1561 aa  834    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  41.12 
 
 		 1578 aa  760    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  41.8 
 
 		 519 aa  317  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1543 aa  256  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  20.53 
 
 		 1821 aa  189  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1584 aa  187  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  30.51 
 
 		 996 aa  172  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  42.77 
 
 		 940 aa  133  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  41.86 
 
 		 541 aa  129  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  42.77 
 
 		 1789 aa  128  8.000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  46.88 
 
 		 1814 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  40.7 
 
 		 844 aa  124  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  46.88 
 
 		 2107 aa  124  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  41.28 
 
 		 679 aa  122  7.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  40.7 
 
 		 4798 aa  120  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  38.69 
 
 		 959 aa  119  6.9999999999999995e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  44.65 
 
 		 1112 aa  118  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  41.72 
 
 		 3598 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0994  hypothetical protein  42.86 
 
 		 585 aa  107  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  43.75 
 
 		 1607 aa  106  5e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  44.52 
 
 		 999 aa  103  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  45.21 
 
 		 1480 aa  103  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  44.93 
 
 		 1805 aa  103  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  42.47 
 
 		 1499 aa  102  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1191  ApxIVA Var3  32.75 
 
 		 428 aa  99  8e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.171556  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0997  hypothetical protein  39.85 
 
 		 582 aa  98.2  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  40.45 
 
 		 4687 aa  97.1  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.35 
 
 		 1925 aa  96.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  39.77 
 
 		 960 aa  89  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2962  hypothetical protein  35.84 
 
 		 326 aa  87.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0055172  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1186  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  32.16 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05714  TAL effector AvrBs3/PthA  28.17 
 
 		 1483 aa  84.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0599163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0597  ApxIVA Var3  35.16 
 
 		 548 aa  84  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24577  predicted protein  28.01 
 
 		 1676 aa  80.9  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0561517  normal  0.0448283 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0927  hypothetical protein  33.71 
 
 		 351 aa  80.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  28.66 
 
 		 423 aa  80.9  0.0000000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1194  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  32.28 
 
 		 928 aa  80.1  0.0000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6671  hypothetical protein  35.26 
 
 		 755 aa  79  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538949  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4716  hypothetical protein  40.37 
 
 		 337 aa  78.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147365 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  48.1 
 
 		 435 aa  78.2  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02272  TAL effector AvrBs3/PthA  28.14 
 
 		 1107 aa  78.6  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0594  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.5 
 
 		 466 aa  76.6  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.353541  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00227  TAL effector AvrBs3/PthA  29.01 
 
 		 1267 aa  76.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.855849  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  35.61 
 
 		 2767 aa  76.3  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0885  hypothetical protein  32.62 
 
 		 788 aa  74.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.854858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00572  TAL effector AvrBs3/PthA  28.66 
 
 		 1047 aa  73.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0332  membrane protein  29.23 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.797962  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0571  hypothetical protein  34.66 
 
 		 2682 aa  73.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00505  TAL effector AvrBs3/PthA  29.22 
 
 		 653 aa  72.8  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.467766  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1306 aa  72.4  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05609  TAL effector AvrBs3/PthA  27.13 
 
 		 1017 aa  72.4  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000182939  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02172  TAL effector AvrBs3/PthA  30.18 
 
 		 1086 aa  70.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2875  hypothetical protein  32.69 
 
 		 435 aa  70.5  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1901  hypothetical protein  29.63 
 
 		 435 aa  70.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0514  hypothetical protein  37.31 
 
 		 351 aa  69.7  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.241085  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0034  hypothetical protein  35.92 
 
 		 327 aa  69.3  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.749355 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1433  hypothetical protein  33.03 
 
 		 320 aa  69.3  0.0000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0949231  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0768  hypothetical protein  33.97 
 
 		 346 aa  67.4  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000331369  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  34.09 
 
 		 3209 aa  67  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  36 
 
 		 2296 aa  67  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00511  TAL effector AvrBs3/PthA  30.27 
 
 		 623 aa  66.2  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0108492  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1995  hypothetical protein  31.14 
 
 		 371 aa  64.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  33.77 
 
 		 1544 aa  64.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1438  type I secretion target GGXGXDXXX repeat-containing protein  31.19 
 
 		 677 aa  63.9  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.191778  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03922  TAL effector AvrBs3/PthA  28.35 
 
 		 1037 aa  63.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147648  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  33.19 
 
 		 2911 aa  63.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00546  TAL effector AvrBs3/PthA  27.84 
 
 		 969 aa  62.8  0.00000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.1176  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1931  hypothetical protein  35.29 
 
 		 354 aa  61.6  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.349657  normal  0.547729 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3648  hypothetical protein  25.48 
 
 		 1616 aa  60.5  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05718  TAL effector AvrBs3/PthA  29.98 
 
 		 868 aa  60.1  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000318376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0371  hypothetical protein  31.86 
 
 		 345 aa  60.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06234  TAL effector AvrBs3/PthA  28.24 
 
 		 983 aa  59.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00915225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01085  TAL effector AvrBs3/PthA  28.24 
 
 		 983 aa  59.7  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00000275966  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1199  hemolysin-type calcium binding protein  30.28 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.506347  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3833  hypothetical protein  32.73 
 
 		 364 aa  58.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00567  TAL effector AvrBs3/PthA  28.22 
 
 		 810 aa  57.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.109196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2746  hypothetical protein  36.45 
 
 		 359 aa  57.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  48.21 
 
 		 1532 aa  55.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06229  TAL effector AvrBs3/PthA  27.7 
 
 		 904 aa  55.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.00614737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0822  membrane protein  27.69 
 
 		 310 aa  55.5  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000142099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05633  TAL effector AvrBs3/PthA  27.7 
 
 		 904 aa  55.5  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00212942  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0082  hypothetical protein  31.85 
 
 		 295 aa  53.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.590083  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0886  hypothetical protein  31.55 
 
 		 2113 aa  54.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1815  hypothetical protein  30.04 
 
 		 1245 aa  54.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00318  TAL effector AvrBs3/PthA  29.28 
 
 		 811 aa  53.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.566935  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2201  hypothetical protein  44.07 
 
 		 265 aa  52.8  0.00007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.139825  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  28.43 
 
 		 3521 aa  52  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0593  internalin-related protein  24.43 
 
 		 631 aa  50.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1114  type VI secretion system Vgr family protein  26.45 
 
 		 713 aa  50.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 1534 aa  50.1  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4814  hypothetical protein  26.17 
 
 		 964 aa  46.6  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00223  TAL effector AvrBs3/PthA  28.15 
 
 		 1068 aa  46.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.973214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>