20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1608 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  100 
 
 
1348 aa  2523    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  26.3 
 
 
1543 aa  342  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02973  ice nucleation protein  69.2 
 
 
276 aa  309  3e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  22.68 
 
 
1821 aa  260  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  21.08 
 
 
1584 aa  231  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2486  S-antigen family protein  33.72 
 
 
467 aa  98.2  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.13457  normal  0.608286 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2485  hypothetical protein  49.11 
 
 
186 aa  93.2  3e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.105961  normal  0.89265 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3947  hypothetical protein  29.56 
 
 
285 aa  86.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.964511  normal  0.031709 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0415  multiple banded antigen  40.74 
 
 
423 aa  84.3  0.00000000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  25.6 
 
 
1561 aa  78.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  25.6 
 
 
1561 aa  71.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  24.4 
 
 
742 aa  65.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2332  Rhs element Vgr protein  22.87 
 
 
741 aa  65.1  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00996193  normal  0.0126654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  37.83 
 
 
1580 aa  59.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  20.67 
 
 
741 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  20.19 
 
 
741 aa  55.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0536  type VI secretion system Vgr family protein  20.5 
 
 
792 aa  50.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3133  Rhs element Vgr protein  23.77 
 
 
767 aa  49.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.054847  normal  0.114782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3489  hypothetical protein  23.77 
 
 
767 aa  49.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.159566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  31.23 
 
 
519 aa  47.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>