81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0734 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  64.65 
 
 
1584 aa  1713    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  100 
 
 
1821 aa  3612    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  73.85 
 
 
1543 aa  1998    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  53.93 
 
 
580 aa  305  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  48.2 
 
 
595 aa  261  8e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  62.05 
 
 
613 aa  261  9e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  48.2 
 
 
595 aa  257  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  22.68 
 
 
1348 aa  255  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  60.73 
 
 
700 aa  251  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  22.9 
 
 
1561 aa  221  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  23.08 
 
 
1561 aa  221  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  58.33 
 
 
564 aa  207  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  59.43 
 
 
559 aa  205  6e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  53.93 
 
 
1108 aa  202  6e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  55 
 
 
502 aa  200  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  54.4 
 
 
451 aa  197  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  44.63 
 
 
467 aa  196  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  52.49 
 
 
464 aa  191  1e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  49.49 
 
 
485 aa  188  7e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  50.83 
 
 
193 aa  188  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  48.31 
 
 
392 aa  183  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  47.21 
 
 
621 aa  181  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  20.07 
 
 
1809 aa  177  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  21.59 
 
 
1578 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  49.17 
 
 
363 aa  169  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  24.29 
 
 
519 aa  158  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  40.68 
 
 
393 aa  157  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  54.08 
 
 
104 aa  114  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  23.59 
 
 
996 aa  111  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2422  hypothetical protein  39.3 
 
 
211 aa  107  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.14602 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  62.03 
 
 
80 aa  106  4e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  24.04 
 
 
495 aa  95.5  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  27.94 
 
 
785 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  33.82 
 
 
669 aa  73.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  39.22 
 
 
524 aa  72.4  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0071  putative CheA signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
1089 aa  71.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.114156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  35 
 
 
652 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  35 
 
 
671 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  35 
 
 
652 aa  69.7  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.37 
 
 
2182 aa  69.7  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  30.67 
 
 
768 aa  67.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.27 
 
 
862 aa  66.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  43.04 
 
 
615 aa  65.9  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  25.83 
 
 
429 aa  63.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  42.17 
 
 
688 aa  60.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  38.75 
 
 
574 aa  60.8  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  34.51 
 
 
681 aa  59.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  32.95 
 
 
2178 aa  59.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  37.65 
 
 
656 aa  58.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 
1424 aa  58.2  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5101  copper resistance B precursor  24.32 
 
 
421 aa  56.6  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.082477 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 
3954 aa  55.5  0.000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0574  CopA family copper resistance protein  36.36 
 
 
619 aa  55.5  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.86 
 
 
2775 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 
928 aa  55.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  38.96 
 
 
3587 aa  55.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02973  ice nucleation protein  22.17 
 
 
276 aa  55.1  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  40.79 
 
 
932 aa  53.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.31 
 
 
3977 aa  53.5  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  22.4 
 
 
484 aa  53.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  32.98 
 
 
1037 aa  52.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 
1764 aa  52.8  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  39.24 
 
 
2950 aa  52  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6219  hypothetical protein  36.84 
 
 
596 aa  51.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  36.59 
 
 
593 aa  52  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.59 
 
 
1180 aa  50.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  38.55 
 
 
928 aa  50.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  38.2 
 
 
4723 aa  49.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0065  hypothetical protein  30.71 
 
 
1024 aa  49.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2623  hypothetical protein  36.36 
 
 
299 aa  49.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00289101  normal  0.54427 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  21.04 
 
 
1288 aa  48.9  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  34.67 
 
 
2342 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  34.67 
 
 
2342 aa  47.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  31.73 
 
 
3587 aa  47.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  38.2 
 
 
782 aa  47  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  35.53 
 
 
659 aa  47.4  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.49 
 
 
3427 aa  46.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0797  outer membrane adhesin like proteiin  31.39 
 
 
1141 aa  46.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000422857  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43450  predicted protein  32.18 
 
 
467 aa  46.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  26.73 
 
 
1121 aa  45.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  38.27 
 
 
942 aa  45.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>