77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0736 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_00841  hypothetical protein  59.53 
 
 
1584 aa  1748    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0734  hypothetical protein  73.85 
 
 
1821 aa  1997    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0736  hypothetical protein  100 
 
 
1543 aa  2996    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1608  hypothetical protein  26.42 
 
 
1348 aa  337  7.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0984785 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15761  hypothetical protein  55.31 
 
 
580 aa  302  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.141645  normal  0.560169 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0744  hypothetical protein  62.05 
 
 
613 aa  261  7e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.316958  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3854  ICE nucleation protein  26.42 
 
 
1561 aa  258  6e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4068  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  26.47 
 
 
1561 aa  256  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.516852 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  47.84 
 
 
595 aa  251  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0740  hypothetical protein  60.73 
 
 
700 aa  250  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.294236  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  48.2 
 
 
595 aa  246  3e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1754  large exoprotein involved in heme utilization or adhesion  20.93 
 
 
1809 aa  224  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0481615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0773  hypothetical protein  22.37 
 
 
1578 aa  210  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.981658  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1389  C-type lectin  58.33 
 
 
564 aa  209  4e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0622  hypothetical protein  54.24 
 
 
1108 aa  202  5e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1391  hypothetical protein  63.46 
 
 
559 aa  201  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  23.62 
 
 
519 aa  197  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00831  hypothetical protein  55 
 
 
502 aa  196  3e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.752054 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0739  hypothetical protein  54.4 
 
 
451 aa  194  8e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.66672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0741  hypothetical protein  44.63 
 
 
467 aa  193  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1385  putative Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  52.49 
 
 
464 aa  188  6e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.516849  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1384  hypothetical protein  51.91 
 
 
485 aa  187  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.539414  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00851  hypothetical protein  50.83 
 
 
193 aa  185  6e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1222  hypothetical protein  48.31 
 
 
392 aa  180  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.111374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0743  hypothetical protein  47.21 
 
 
621 aa  180  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00651  hypothetical protein  49.17 
 
 
363 aa  170  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.2704  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20971  hypothetical protein  40.68 
 
 
393 aa  158  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.468089 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5533  hypothetical protein  24.25 
 
 
996 aa  122  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1397  hypothetical protein  54.08 
 
 
104 aa  117  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0311355  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00961  hypothetical protein  62.03 
 
 
80 aa  105  9e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.312984  normal  0.920257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  28.1 
 
 
785 aa  75.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.6 
 
 
862 aa  76.3  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4218  Allergen V5/Tpx-1 related  39.22 
 
 
524 aa  72.8  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.245286  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02973  ice nucleation protein  31.43 
 
 
276 aa  72.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6113  Cu(II)/Cu(I) resistance outer membrane protein CopB  22.78 
 
 
495 aa  68.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.109399  normal  0.679723 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0243  hemolysin-type calcium-binding region  29.78 
 
 
768 aa  68.2  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0406  alkaline phosphatase  43.37 
 
 
2182 aa  68.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0745  hypothetical protein  43.04 
 
 
615 aa  63.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.676987  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21051  hypothetical protein  28.07 
 
 
2178 aa  62  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.466354 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1557  hypothetical protein  34.51 
 
 
681 aa  60.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.208661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6311  lipolytic protein G-D-S-L family  42.17 
 
 
688 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5380  copper resistance protein A  30.5 
 
 
669 aa  60.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.537951 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  48.35 
 
 
839 aa  60.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1896  hypothetical protein  38.75 
 
 
574 aa  59.3  0.0000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  32.5 
 
 
652 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  32.5 
 
 
652 aa  58.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0015  CopA family copper resistance protein  33.05 
 
 
671 aa  57.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.156592  normal  0.0651456 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1912  Allergen V5/Tpx-1 related  46.48 
 
 
264 aa  57.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0614362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  26.57 
 
 
4334 aa  57.8  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  32.98 
 
 
1037 aa  57  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  42.86 
 
 
1424 aa  56.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  37.65 
 
 
656 aa  56.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  42.31 
 
 
3954 aa  56.2  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 
928 aa  53.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  38.96 
 
 
3587 aa  53.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2500  Hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
932 aa  53.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  41.86 
 
 
2775 aa  52.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0931  hemolysin-type calcium-binding region  23.95 
 
 
484 aa  52.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0749025  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1750  5'-nucleotidase domain-containing protein  42.31 
 
 
3977 aa  52.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3984  hypothetical protein  15.28 
 
 
742 aa  51.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.580722  hitchhiker  0.00476383 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  38.04 
 
 
1764 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1699  hypothetical protein  36.59 
 
 
593 aa  50.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00360282  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.59 
 
 
1180 aa  50.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  38.55 
 
 
928 aa  50.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  47.06 
 
 
846 aa  50.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  39.24 
 
 
2950 aa  50.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  38.2 
 
 
4723 aa  49.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3614  Forkhead-associated protein  38.61 
 
 
835 aa  47.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.158405  hitchhiker  0.00251691 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  38.96 
 
 
3587 aa  46.2  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1839  copper resistance B precursor  20.93 
 
 
429 aa  46.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.425584  hitchhiker  0.0000315743 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0876  hypothetical protein  26.73 
 
 
1121 aa  46.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.728524 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46350  serine peptidase  36.62 
 
 
659 aa  45.8  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.614048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1794  hypothetical protein  30.61 
 
 
480 aa  45.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0790951 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  38.37 
 
 
782 aa  45.8  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  36.49 
 
 
3427 aa  45.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  38.96 
 
 
942 aa  45.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4924  serine protease  36.84 
 
 
1805 aa  45.1  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>