More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0791 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.28 
 
 
3619 aa  1195    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  41.57 
 
 
1712 aa  759    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  42.31 
 
 
3608 aa  1207    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.42 
 
 
3619 aa  1204    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  59.5 
 
 
3587 aa  934    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  46.05 
 
 
2342 aa  1229    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  57.14 
 
 
3094 aa  1607    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  59.38 
 
 
3587 aa  932    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  46.62 
 
 
2342 aa  1248    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  100 
 
 
2950 aa  5807    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  44.05 
 
 
1625 aa  876    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.54 
 
 
1415 aa  275  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  36.24 
 
 
2911 aa  243  4e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  34.76 
 
 
2097 aa  228  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  34.71 
 
 
2807 aa  224  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  36.13 
 
 
2467 aa  222  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  35.23 
 
 
1079 aa  221  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  36.17 
 
 
2133 aa  218  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  32.6 
 
 
1145 aa  214  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.86 
 
 
3954 aa  200  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  40.44 
 
 
2198 aa  196  7e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.91 
 
 
1133 aa  195  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  36.07 
 
 
4334 aa  185  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  37.5 
 
 
3209 aa  180  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  30.63 
 
 
1855 aa  179  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  32.6 
 
 
1134 aa  176  7.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  31.99 
 
 
2954 aa  172  9e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 
1582 aa  167  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.07 
 
 
1363 aa  167  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  44.7 
 
 
768 aa  167  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  34.01 
 
 
1884 aa  166  5.0000000000000005e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  32.32 
 
 
1279 aa  166  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  34 
 
 
1534 aa  165  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 
1532 aa  165  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  31.9 
 
 
824 aa  163  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  36.64 
 
 
820 aa  157  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  32.61 
 
 
851 aa  155  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  36.45 
 
 
1213 aa  152  6e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  32.97 
 
 
1764 aa  152  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  39.21 
 
 
1610 aa  151  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.59 
 
 
4800 aa  150  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  40.52 
 
 
395 aa  149  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  40.52 
 
 
395 aa  149  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.71 
 
 
1400 aa  145  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  35.96 
 
 
574 aa  145  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  31.62 
 
 
1544 aa  144  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.43 
 
 
1499 aa  144  3e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  30.38 
 
 
3026 aa  142  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  33.68 
 
 
946 aa  142  1e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  30.96 
 
 
833 aa  140  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.82 
 
 
1156 aa  134  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.9 
 
 
1795 aa  132  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  37.32 
 
 
907 aa  132  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  31.8 
 
 
1628 aa  132  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  30.78 
 
 
1864 aa  132  1.0000000000000001e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.2 
 
 
2667 aa  132  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  33.2 
 
 
556 aa  131  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  37.5 
 
 
1424 aa  131  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  32.59 
 
 
764 aa  129  8.000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  35.1 
 
 
1112 aa  129  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  30.23 
 
 
2107 aa  125  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  30.14 
 
 
1072 aa  124  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.76 
 
 
1180 aa  123  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  28.46 
 
 
1286 aa  123  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  34.96 
 
 
795 aa  122  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  33.57 
 
 
2836 aa  121  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.82 
 
 
1480 aa  120  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  26.56 
 
 
2245 aa  120  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  29.23 
 
 
860 aa  120  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  30.65 
 
 
965 aa  120  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.85 
 
 
2105 aa  119  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.1 
 
 
2678 aa  119  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  34.15 
 
 
1112 aa  119  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.47 
 
 
1197 aa  119  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  47.65 
 
 
2701 aa  118  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  38.61 
 
 
503 aa  117  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.43 
 
 
1029 aa  117  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  38.43 
 
 
1029 aa  117  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  33.11 
 
 
595 aa  117  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.4 
 
 
2689 aa  117  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1463  VCBS  39.61 
 
 
2887 aa  116  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.743526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4084  mannuronan C-5-epimerase, putative  35.88 
 
 
1610 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.202459  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.65 
 
 
1895 aa  115  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  41.67 
 
 
467 aa  115  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.83 
 
 
3427 aa  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  39.29 
 
 
1236 aa  114  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  26.78 
 
 
3598 aa  114  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  46.26 
 
 
1650 aa  113  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  26.83 
 
 
1814 aa  113  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  36.06 
 
 
1164 aa  112  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  30.87 
 
 
745 aa  112  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  37.84 
 
 
503 aa  112  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  28.7 
 
 
1383 aa  111  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4884  serralysin  45.18 
 
 
727 aa  112  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  41.59 
 
 
475 aa  110  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  35.74 
 
 
648 aa  109  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  41.12 
 
 
475 aa  109  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  33.02 
 
 
462 aa  107  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  28.05 
 
 
1306 aa  107  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  28.17 
 
 
4798 aa  106  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>