More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0249 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  90.87 
 
 		 1156 aa  1447    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  100 
 
 		 1499 aa  2926    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  48.51 
 
 		 999 aa  777    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  48.86 
 
 		 1480 aa  1016    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.3 
 
 		 2107 aa  580  1e-164  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1592  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  37.15 
 
 		 1789 aa  549  1e-154  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  35.19 
 
 		 1814 aa  534  1e-150  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  33.75 
 
 		 3598 aa  532  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0299  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  35.68 
 
 		 1607 aa  497  1e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  41.35 
 
 		 855 aa  493  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.75 
 
 		 2954 aa  386  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  35.5 
 
 		 1217 aa  358  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  35.24 
 
 		 4798 aa  346  2e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1648  hemolysin-type calcium binding protein  37.59 
 
 		 940 aa  339  2.9999999999999997e-91  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  31.54 
 
 		 1112 aa  327  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6773  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.7 
 
 		 1925 aa  325  6e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  32.64 
 
 		 860 aa  305  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  31.39 
 
 		 3209 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  29.52 
 
 		 2245 aa  278  6e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  33.55 
 
 		 1363 aa  262  4e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06446  hypothetical protein  31.45 
 
 		 959 aa  261  7e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  33.3 
 
 		 1400 aa  254  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  37.93 
 
 		 946 aa  251  8e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.34 
 
 		 3954 aa  240  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  35.9 
 
 		 1279 aa  229  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.56 
 
 		 4334 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  31.51 
 
 		 2689 aa  213  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  33.52 
 
 		 1197 aa  210  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.91 
 
 		 1884 aa  201  7e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  31.98 
 
 		 2911 aa  199  4.0000000000000005e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.96 
 
 		 2678 aa  194  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0104  putative hemolysin-type calcium-binding protein  29.44 
 
 		 960 aa  194  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  33.46 
 
 		 965 aa  194  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  33 
 
 		 1079 aa  191  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  34.52 
 
 		 1534 aa  188  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  29.43 
 
 		 4687 aa  188  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.09 
 
 		 4800 aa  183  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 		 1795 aa  182  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.98 
 
 		 1145 aa  182  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  31.37 
 
 		 1855 aa  179  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  34.16 
 
 		 556 aa  177  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  31.01 
 
 		 1421 aa  172  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1963  hypothetical protein  26.54 
 
 		 1306 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  37.72 
 
 		 595 aa  167  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  30.79 
 
 		 1383 aa  165  7e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  34.11 
 
 		 1164 aa  164  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  36.22 
 
 		 2105 aa  164  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  27.62 
 
 		 1532 aa  163  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  29.04 
 
 		 1544 aa  162  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  32.4 
 
 		 2775 aa  161  7e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  33.93 
 
 		 1424 aa  160  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.49 
 
 		 2836 aa  158  6e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.84 
 
 		 1415 aa  158  8e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51240  Calcium-binding protein  27.87 
 
 		 1168 aa  157  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.214851  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  30.85 
 
 		 1895 aa  157  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  29.27 
 
 		 4723 aa  157  2e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  32.94 
 
 		 824 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  34.63 
 
 		 2667 aa  152  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  31.99 
 
 		 1582 aa  152  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  34.18 
 
 		 980 aa  152  6e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.92 
 
 		 3619 aa  151  7e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.64 
 
 		 3427 aa  151  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.63 
 
 		 1180 aa  149  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  36.92 
 
 		 3619 aa  149  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  29.87 
 
 		 2097 aa  147  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2206  Cadherin  29.9 
 
 		 928 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.802036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  35.56 
 
 		 526 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  27.58 
 
 		 2467 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.19 
 
 		 3608 aa  141  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6493  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  28.91 
 
 		 1102 aa  140  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  31.51 
 
 		 518 aa  140  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  28.38 
 
 		 3026 aa  139  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  38.52 
 
 		 341 aa  138  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  30.83 
 
 		 942 aa  138  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  39.34 
 
 		 387 aa  137  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  34.77 
 
 		 613 aa  137  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  31.6 
 
 		 833 aa  135  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1250  hypothetical protein  40.64 
 
 		 541 aa  135  7.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  39.73 
 
 		 679 aa  134  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1000  Hemolysin-type calcium-binding region  38.99 
 
 		 844 aa  134  9e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.862975  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3919  hemolysin-type calcium-binding region  33.5 
 
 		 393 aa  134  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  29.01 
 
 		 2807 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  36.56 
 
 		 387 aa  132  7.000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  31.05 
 
 		 928 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  37.43 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  32.96 
 
 		 2145 aa  130  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  41.18 
 
 		 833 aa  129  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  36.83 
 
 		 615 aa  129  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  32.73 
 
 		 5769 aa  128  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  33.63 
 
 		 820 aa  123  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  32.76 
 
 		 1236 aa  124  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.89 
 
 		 9867 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  34.44 
 
 		 460 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  35.92 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2542  Hemolysin-type calcium-binding region  34.19 
 
 		 485 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1572  bacteriocin  70.59 
 
 		 435 aa  119  3.9999999999999997e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.301349  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  38.44 
 
 		 491 aa  119  5e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51180  Secreted mannuronan C-5 epimerase  28.23 
 
 		 998 aa  117  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  34.65 
 
 		 313 aa  117  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  27.71 
 
 		 2950 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>