More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4884 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4884  serralysin  100 
 
 
727 aa  1448    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4143  alkaline metalloproteinase precursor  39.47 
 
 
479 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.100514  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2112  Serralysin  39.91 
 
 
478 aa  244  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.69031  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48060  alkaline metalloproteinase precursor  40.05 
 
 
479 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0741923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2678  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  39.95 
 
 
486 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00596813 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2111  Serralysin  39.09 
 
 
481 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  37.9 
 
 
480 aa  234  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2909  Serralysin  38.88 
 
 
474 aa  232  2e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0210  serralysin  38.6 
 
 
504 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00868189 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2387  serralysin  35.67 
 
 
490 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.590992  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3332  alkaline metalloendoprotease  37.53 
 
 
475 aa  227  7e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3163  serralysin  37.17 
 
 
476 aa  225  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.829675  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  37.7 
 
 
476 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3363  epralysin. metallo peptidase. MEROPS family M10B  38.33 
 
 
468 aa  218  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  34.5 
 
 
820 aa  192  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  33.08 
 
 
1133 aa  178  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  32.63 
 
 
648 aa  174  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  32.75 
 
 
531 aa  171  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  32.55 
 
 
531 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2424  glycoside hydrolase family protein  51.79 
 
 
467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  45.49 
 
 
1019 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  32.65 
 
 
614 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3983  serralysin  34.79 
 
 
785 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  51.31 
 
 
3209 aa  160  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0118  serralysin  33.33 
 
 
444 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4037  metalloprotease  33.33 
 
 
442 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3059  hemolysin-type calcium-binding region:peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.28 
 
 
535 aa  157  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.196168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  47.15 
 
 
1055 aa  157  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  48.08 
 
 
475 aa  157  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  32.26 
 
 
745 aa  154  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
3954 aa  154  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3193  metalloprotease, putative  29.84 
 
 
535 aa  154  7e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.839169  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  47.12 
 
 
475 aa  153  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4088  metalloprotease  33.25 
 
 
444 aa  153  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.850416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  29.55 
 
 
1134 aa  152  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  44.54 
 
 
824 aa  151  4e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0627  peptidase M10, serralysin-like protein  33.91 
 
 
606 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  43.07 
 
 
4334 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.13 
 
 
1029 aa  144  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  40.13 
 
 
1029 aa  144  8e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  44.09 
 
 
1197 aa  143  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  37.17 
 
 
2133 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  30.75 
 
 
1112 aa  136  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0430  metallophosphoesterase  35.2 
 
 
2701 aa  134  6e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  41.2 
 
 
2198 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  47.62 
 
 
1855 aa  134  7.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3849  calcium-binding protein, hemolysin-type  43.6 
 
 
768 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184239  normal  0.669368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  42.32 
 
 
2954 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1442  metalloprotease  28.8 
 
 
513 aa  127  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.066501  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  27.8 
 
 
1112 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  45.31 
 
 
3026 aa  126  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  39.74 
 
 
907 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  51.25 
 
 
3619 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  49.15 
 
 
2467 aa  123  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  40.08 
 
 
462 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  51.25 
 
 
3619 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1708  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 
395 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  44.04 
 
 
3608 aa  121  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  39.08 
 
 
2807 aa  120  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.8 
 
 
588 aa  120  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  39.68 
 
 
486 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  38.37 
 
 
503 aa  119  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2426  hemolysin-type calcium-binding region  39.15 
 
 
503 aa  118  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0755943  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1733  Ig family protein  48.85 
 
 
395 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.16 
 
 
1415 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 
1764 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  48.31 
 
 
1079 aa  113  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3402  neutral zinc metallopeptidase  31.94 
 
 
451 aa  112  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  45.41 
 
 
2097 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  46.53 
 
 
946 aa  111  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4091  hemolysin-type calcium-binding region  38.68 
 
 
313 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.402698 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  48.65 
 
 
851 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  44.14 
 
 
448 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  34.45 
 
 
1610 aa  105  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  44.44 
 
 
546 aa  105  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  43.16 
 
 
1534 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  41.7 
 
 
1164 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  34.12 
 
 
759 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.06 
 
 
813 aa  101  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2493  serralysin  35.37 
 
 
1631 aa  102  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0241163  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  42.44 
 
 
2105 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  39.02 
 
 
2911 aa  101  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  36.84 
 
 
980 aa  100  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  41.48 
 
 
1650 aa  99.8  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.83 
 
 
1795 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  42.61 
 
 
1532 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  37.76 
 
 
1712 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  39.46 
 
 
982 aa  99  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.88 
 
 
2678 aa  98.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3922  hemolysin-type calcium-binding protein  33.69 
 
 
313 aa  96.3  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  35.9 
 
 
1236 aa  95.5  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3220  hypothetical protein  34.27 
 
 
713 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160301  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  40.37 
 
 
1424 aa  94.4  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3544  hypothetical protein  33.92 
 
 
713 aa  94.4  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0512372  normal  0.231679 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  34.19 
 
 
1480 aa  94  9e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  34.38 
 
 
2567 aa  92.4  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  32.74 
 
 
1883 aa  92.8  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  38.19 
 
 
4687 aa  92.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  30.49 
 
 
1499 aa  92.4  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  31.76 
 
 
1156 aa  91.7  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>