More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4058 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  100 
 
 		 1072 aa  1976    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  33.96 
 
 		 2097 aa  337  7.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  34.32 
 
 		 2911 aa  329  2.0000000000000001e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  33.39 
 
 		 4800 aa  303  9e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  30.5 
 
 		 1884 aa  298  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.31 
 
 		 1145 aa  289  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  32.5 
 
 		 1582 aa  274  6e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  34.98 
 
 		 833 aa  254  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1509  hemolysin-type calcium-binding region  31.62 
 
 		 1628 aa  241  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.46 
 
 		 1415 aa  238  6e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0160  Hemolysin-type calcium-binding protein  33.49 
 
 		 1390 aa  233  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  29.53 
 
 		 1079 aa  218  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1879  Hemolysin-type calcium-binding region  30.62 
 
 		 2836 aa  209  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  29.76 
 
 		 1400 aa  206  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0556  proprotein convertase P  30.94 
 
 		 764 aa  205  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.392755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4247  hemolysin-type calcium-binding region  30.71 
 
 		 1213 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.803937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  30.15 
 
 		 3954 aa  203  1.9999999999999998e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  31.06 
 
 		 4334 aa  182  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  31.15 
 
 		 1286 aa  181  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  29.41 
 
 		 1855 aa  171  7e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  28.92 
 
 		 1544 aa  168  5e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2326  hemolysin-type calcium-binding region  28.85 
 
 		 2467 aa  168  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  31.77 
 
 		 946 aa  153  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3539  hemolysin-type calcium-binding region, RTX  32.21 
 
 		 556 aa  151  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.223263  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 		 1895 aa  149  3e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4705  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  29.25 
 
 		 1133 aa  148  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0427656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.3 
 
 		 1363 aa  148  6e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  31.03 
 
 		 965 aa  146  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5278  peptidase domain-containing protein  33.5 
 
 		 1112 aa  144  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0616  peptidase, metallopeptidases  32.13 
 
 		 745 aa  141  6e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.52 
 
 		 1279 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  27.35 
 
 		 2954 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3182  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.61 
 
 		 2678 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.8 
 
 		 1499 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3993  hemolysin-type calcium-binding protein  31.05 
 
 		 1112 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.515402  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4542  serralysin  29.13 
 
 		 1134 aa  129  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.303365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  29.38 
 
 		 1156 aa  126  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  32.93 
 
 		 357 aa  126  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5000  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 574 aa  125  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  30.28 
 
 		 824 aa  125  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  30.64 
 
 		 2807 aa  125  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  29.39 
 
 		 795 aa  124  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.18 
 
 		 1534 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1200  hemolysin-type calcium-binding region  25.55 
 
 		 1864 aa  122  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0007986  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2334  lipase, class 3  27.37 
 
 		 2133 aa  120  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.352335  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  31.43 
 
 		 2775 aa  119  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  28.76 
 
 		 1764 aa  119  3e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4160  VCBS  28.71 
 
 		 6581 aa  115  5e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.530259 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1424 aa  112  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  30 
 
 		 595 aa  110  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  30.14 
 
 		 589 aa  109  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  38.82 
 
 		 1236 aa  107  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  31.77 
 
 		 648 aa  106  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.69 
 
 		 1795 aa  107  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  32.33 
 
 		 833 aa  106  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1397  peptidase M10, serralysin-like protein  35.77 
 
 		 614 aa  106  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.11813  normal  0.552003 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06445  bifunctional hemolysin-adenylate cyclase  27.91 
 
 		 860 aa  104  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5971  VCBS  41.2 
 
 		 1883 aa  103  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  36.61 
 
 		 1557 aa  103  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  28.99 
 
 		 2950 aa  102  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  33.96 
 
 		 3619 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  31.12 
 
 		 820 aa  102  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  29.21 
 
 		 1532 aa  102  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0230  neutral zinc metallopeptidase  39.04 
 
 		 531 aa  101  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  30.41 
 
 		 3209 aa  101  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  32.57 
 
 		 2667 aa  101  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1512  hemolysin-type calcium binding domain-containing protein  27.87 
 
 		 2107 aa  100  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.821841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  34.11 
 
 		 3619 aa  100  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.66 
 
 		 813 aa  100  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1872  serralysin  38.5 
 
 		 531 aa  99.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.043105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1562  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  30.87 
 
 		 769 aa  99.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.618227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0612  hemolysin-type calcium-binding region  35.5 
 
 		 12741 aa  98.6  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.31 
 
 		 2689 aa  98.6  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5959  outer membrane adhesin like proteiin  36.19 
 
 		 2567 aa  98.2  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.33422  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7966  Hemolysin-type calcium-binding region  35.45 
 
 		 341 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  31.55 
 
 		 1164 aa  97.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  29.62 
 
 		 1421 aa  96.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  33.85 
 
 		 1712 aa  96.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4185  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.74 
 
 		 1029 aa  95.5  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.610735 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3855  hemolysin-type calcium-binding protein  35.74 
 
 		 1029 aa  95.5  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.460711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3007  hemolysin-type calcium-binding region  34.9 
 
 		 363 aa  95.1  6e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.448328  normal  0.231558 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1748  Hemolysin-type calcium-binding region  38.86 
 
 		 759 aa  94.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.155596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  29.11 
 
 		 1287 aa  94  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4357  Hemolysin-type calcium-binding region  36.65 
 
 		 546 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  32.25 
 
 		 2105 aa  93.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  33.56 
 
 		 3608 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3823  putative hemolysin-type calcium-binding region  35.46 
 
 		 1610 aa  92.8  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00466543 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  31.94 
 
 		 4687 aa  93.2  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  26.37 
 
 		 1480 aa  92  5e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  29.58 
 
 		 851 aa  91.3  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.47 
 
 		 1180 aa  91.3  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.88 
 
 		 3427 aa  90.1  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  26.21 
 
 		 855 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  26.96 
 
 		 3026 aa  89.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4254  Hemolysin-type calcium-binding region  36.95 
 
 		 540 aa  89  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0358  hemolysin-type calcium-binding region  31.58 
 
 		 503 aa  88.2  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  29.33 
 
 		 518 aa  88.2  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3886  hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 		 540 aa  88.2  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.559219  normal  0.150584 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2596  Hemolysin-type calcium-binding region  43.79 
 
 		 1971 aa  87.4  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1569  Hemolysin-type calcium-binding region  32.54 
 
 		 341 aa  87.4  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.722713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>