More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0108 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2871  Animal heme peroxidase  41.33 
 
 		 1712 aa  811    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  42.57 
 
 		 3619 aa  1051    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2298  heme peroxidase  41.36 
 
 		 1650 aa  1056    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  42.31 
 
 		 3608 aa  1058    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1979  Animal heme peroxidase  48.78 
 
 		 3587 aa  819    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  98.93 
 
 		 2342 aa  4624    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1560  heme peroxidase  48.08 
 
 		 3094 aa  1178    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.508144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  44.4 
 
 		 2950 aa  1261    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1243  heme peroxidase  39.97 
 
 		 1625 aa  887    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.941188  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  100 
 
 		 2342 aa  4664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1662  heme peroxidase  48.64 
 
 		 3587 aa  820    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  42.54 
 
 		 3619 aa  1052    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  58.24 
 
 		 2796 aa  385  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  60.9 
 
 		 1632 aa  348  7e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  59.21 
 
 		 1806 aa  348  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  43.55 
 
 		 849 aa  196  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  52.26 
 
 		 361 aa  178  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  51.76 
 
 		 361 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  52.02 
 
 		 361 aa  174  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  38.49 
 
 		 857 aa  152  7e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.53 
 
 		 1067 aa  151  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  37.24 
 
 		 665 aa  128  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  35.69 
 
 		 1044 aa  125  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  51.75 
 
 		 746 aa  122  9e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.6 
 
 		 1366 aa  120  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 		 872 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  32.34 
 
 		 1059 aa  110  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  32.34 
 
 		 1035 aa  110  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  46.61 
 
 		 678 aa  109  7e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  32.76 
 
 		 995 aa  107  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 		 1264 aa  107  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 		 1152 aa  102  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  43.08 
 
 		 1152 aa  102  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  33.68 
 
 		 987 aa  101  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  48.31 
 
 		 521 aa  98.6  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  41.28 
 
 		 980 aa  97.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.31 
 
 		 2775 aa  94  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  32.3 
 
 		 1247 aa  92.8  6e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  31.87 
 
 		 1279 aa  92.4  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.26 
 
 		 795 aa  92  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  37.7 
 
 		 2105 aa  91.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2936  peroxidase  27.72 
 
 		 714 aa  90.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.208315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  35.87 
 
 		 597 aa  90.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  38.94 
 
 		 518 aa  90.1  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  37.9 
 
 		 305 aa  89.4  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  31.77 
 
 		 1079 aa  89.4  8e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.66 
 
 		 1236 aa  88.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 		 756 aa  88.2  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.44 
 
 		 1963 aa  88.2  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  58.57 
 
 		 120 aa  87.4  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  54.93 
 
 		 115 aa  87  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.65 
 
 		 916 aa  86.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  45.36 
 
 		 535 aa  86.7  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  38.01 
 
 		 946 aa  86.3  0.000000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  36.78 
 
 		 1287 aa  85.9  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1662  hemolysin-type calcium-binding region  41.08 
 
 		 260 aa  85.9  0.000000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  37.43 
 
 		 1164 aa  85.9  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.75 
 
 		 1895 aa  85.1  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.49 
 
 		 1795 aa  85.5  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  32.39 
 
 		 3209 aa  85.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  56.34 
 
 		 227 aa  84.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1416  hypothetical protein  44.83 
 
 		 1424 aa  84.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.79 
 
 		 526 aa  84.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  38.76 
 
 		 813 aa  85.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  42.86 
 
 		 294 aa  84.7  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  42.86 
 
 		 294 aa  83.6  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  32.13 
 
 		 639 aa  84  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  51.39 
 
 		 255 aa  83.2  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.13 
 
 		 3427 aa  82.8  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  36.29 
 
 		 592 aa  82.8  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.1 
 
 		 1016 aa  82.8  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  36.41 
 
 		 219 aa  82  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  51.95 
 
 		 137 aa  82  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  35.74 
 
 		 2667 aa  81.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1349  hemolysin-type calcium-binding region  37.36 
 
 		 744 aa  82.4  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  31.23 
 
 		 1480 aa  82  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  39.63 
 
 		 709 aa  82  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  38.82 
 
 		 613 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  37.61 
 
 		 982 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  30.62 
 
 		 833 aa  82  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  37.77 
 
 		 2954 aa  82  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  35.65 
 
 		 460 aa  81.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  54.17 
 
 		 680 aa  81.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  41.96 
 
 		 294 aa  81.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  30.79 
 
 		 679 aa  81.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  51.95 
 
 		 137 aa  80.9  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  32.2 
 
 		 235 aa  80.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  29.76 
 
 		 741 aa  80.1  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  39.62 
 
 		 1855 aa  80.1  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 615 aa  80.1  0.0000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0529  hypothetical protein  26.65 
 
 		 4697 aa  79.7  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 1322 aa  79.7  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  41.84 
 
 		 280 aa  79.3  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  39.05 
 
 		 4334 aa  79.3  0.0000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  32.02 
 
 		 9867 aa  79.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  32.54 
 
 		 855 aa  78.6  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.85 
 
 		 588 aa  78.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  38.12 
 
 		 1363 aa  78.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5074  Hemolysin-type calcium-binding region  50 
 
 		 782 aa  78.6  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  32.92 
 
 		 734 aa  79  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>