98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1218 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  100 
 
 
518 aa  1086    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  41.16 
 
 
956 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  42.56 
 
 
1084 aa  218  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  32.19 
 
 
1236 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  44.36 
 
 
1152 aa  195  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  44.55 
 
 
329 aa  195  2e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  39.5 
 
 
988 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  39.64 
 
 
219 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  42.98 
 
 
1476 aa  187  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  39.19 
 
 
219 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  43.08 
 
 
219 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  43.08 
 
 
219 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  43.08 
 
 
219 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  35.07 
 
 
1119 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  43.08 
 
 
219 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  43.08 
 
 
219 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  43.08 
 
 
219 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
1334 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  42.56 
 
 
219 aa  177  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  41.83 
 
 
219 aa  176  9e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 
994 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  43.8 
 
 
849 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  38.28 
 
 
746 aa  96.7  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
1067 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
1152 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  42.74 
 
 
678 aa  92  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 
1152 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  38.94 
 
 
2342 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  38.94 
 
 
2342 aa  90.1  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  37.1 
 
 
521 aa  87  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  39.84 
 
 
1247 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
535 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 
361 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  33.55 
 
 
1366 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 
361 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  31.78 
 
 
1044 aa  82  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 
872 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
857 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  41.44 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  34.38 
 
 
294 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.7 
 
 
2796 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  35.71 
 
 
1632 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  33.75 
 
 
294 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.92 
 
 
1806 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  39.76 
 
 
665 aa  73.6  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  46.05 
 
 
680 aa  72.4  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  30.61 
 
 
597 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  32.91 
 
 
294 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  27.07 
 
 
756 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  32.76 
 
 
305 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  32.03 
 
 
995 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.27 
 
 
916 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  38.2 
 
 
223 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.19 
 
 
1317 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
987 aa  66.6  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  28.57 
 
 
235 aa  65.1  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
1059 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 
1035 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  36.23 
 
 
255 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  38.03 
 
 
227 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  34.59 
 
 
462 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  34.78 
 
 
644 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2168  glycosyl transferase, group 1  30.39 
 
 
1770 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.377633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  42.19 
 
 
120 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  40.62 
 
 
115 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
1313 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
1322 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  40.32 
 
 
592 aa  54.3  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  28.35 
 
 
1880 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  37.66 
 
 
137 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  27.87 
 
 
882 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  34.67 
 
 
751 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  34.67 
 
 
751 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  28.26 
 
 
1264 aa  52  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  39.22 
 
 
399 aa  52  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  33.98 
 
 
1301 aa  51.2  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  37.66 
 
 
137 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0148  hypothetical protein  24.86 
 
 
222 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.434014 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  37.66 
 
 
137 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  29.79 
 
 
252 aa  48.9  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  35.96 
 
 
1302 aa  49.3  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0289  hypothetical protein  23.43 
 
 
239 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.159555  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0205  hypothetical protein  24.86 
 
 
222 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.314754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  36.62 
 
 
355 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  31.5 
 
 
830 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  40 
 
 
736 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0447  glycosyltransferase-like protein  24.69 
 
 
264 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  33.87 
 
 
322 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  33.33 
 
 
1161 aa  45.1  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  25.35 
 
 
2296 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  34.78 
 
 
513 aa  44.3  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2360  hypothetical protein  45.24 
 
 
247 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.699559  normal  0.535818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  29.33 
 
 
814 aa  44.3  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  31.78 
 
 
1313 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  46.67 
 
 
828 aa  44.3  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1944  putative methyltransferase  26.42 
 
 
243 aa  44.3  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.197915  hitchhiker  0.0000642802 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28 
 
 
418 aa  43.9  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>