More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6257 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
987 aa  1986    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  48.12 
 
 
1059 aa  835    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  43.32 
 
 
1322 aa  702    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  48.53 
 
 
995 aa  827    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
1313 aa  707    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  48.42 
 
 
1035 aa  840    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  36.92 
 
 
814 aa  438  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  40.5 
 
 
1673 aa  396  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  41.03 
 
 
1287 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  39.55 
 
 
1312 aa  369  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 
1317 aa  357  5e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
1314 aa  345  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  39.64 
 
 
746 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  35.05 
 
 
1444 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  31.59 
 
 
1256 aa  263  8e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  33.28 
 
 
1185 aa  263  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  36.54 
 
 
1008 aa  249  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
953 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  38.97 
 
 
723 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  38.18 
 
 
852 aa  200  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.33 
 
 
862 aa  193  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
827 aa  190  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
850 aa  183  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  38.66 
 
 
818 aa  174  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 
818 aa  173  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  32.31 
 
 
849 aa  127  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  27.08 
 
 
857 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  30.37 
 
 
1067 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  30.74 
 
 
680 aa  109  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
1523 aa  106  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.34 
 
 
1600 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  29.45 
 
 
1632 aa  102  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  33.68 
 
 
2342 aa  100  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  32.99 
 
 
2342 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  30.58 
 
 
1523 aa  99.4  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.49 
 
 
1806 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  29.11 
 
 
785 aa  96.3  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 
369 aa  97.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  31.55 
 
 
665 aa  96.3  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 
1162 aa  95.9  4e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  28.27 
 
 
387 aa  94.7  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  30.7 
 
 
1119 aa  94  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
1268 aa  94  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.11 
 
 
1435 aa  93.2  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  32.14 
 
 
1044 aa  93.2  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  29.96 
 
 
2796 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.92 
 
 
1366 aa  90.5  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
624 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
1264 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
1340 aa  87.4  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
679 aa  85.1  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  27.84 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  30.15 
 
 
597 aa  84.3  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.11 
 
 
916 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  26.92 
 
 
616 aa  80.1  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  26.79 
 
 
340 aa  77.4  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 
1247 aa  77.4  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.04 
 
 
1077 aa  76.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 
872 aa  76.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3226  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
817 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  26.6 
 
 
2401 aa  73.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
1152 aa  71.2  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  29.71 
 
 
1067 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
658 aa  70.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
1400 aa  70.5  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  31.93 
 
 
223 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.56 
 
 
457 aa  69.7  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  29.8 
 
 
235 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  30.06 
 
 
756 aa  69.3  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2807  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 
419 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  26.82 
 
 
1152 aa  68.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3806  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
428 aa  67.4  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.773329  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  26.16 
 
 
860 aa  66.6  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  34.29 
 
 
518 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 
535 aa  65.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.64 
 
 
361 aa  65.5  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.57 
 
 
336 aa  65.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
280 aa  65.1  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4234  glycosyl transferase family protein  25.42 
 
 
310 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0220827  hitchhiker  0.000823038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
334 aa  65.1  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
313 aa  65.1  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0578  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
525 aa  65.1  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  29.31 
 
 
300 aa  64.7  0.000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0557  hypothetical protein  25.18 
 
 
284 aa  64.3  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.17155  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  28.37 
 
 
301 aa  64.3  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  47.89 
 
 
115 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 
361 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  47.89 
 
 
120 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  23.87 
 
 
330 aa  64.3  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  39.53 
 
 
305 aa  64.3  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.27 
 
 
358 aa  63.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0736  glycosyl transferase family protein  27.51 
 
 
326 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59773 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
902 aa  63.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
334 aa  63.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2778  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
413 aa  63.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.298779 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  23.11 
 
 
329 aa  63.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  32.04 
 
 
521 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  43.94 
 
 
227 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>