71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1212 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  626  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  39.36 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  38.65 
 
 		 294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  38.3 
 
 		 294 aa  195  6e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  46.36 
 
 		 1152 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  46.36 
 
 		 1152 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  34.93 
 
 		 746 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  43.22 
 
 		 849 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  37.9 
 
 		 2342 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  40.54 
 
 		 1067 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  37.9 
 
 		 2342 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  42.15 
 
 		 1632 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  37.8 
 
 		 1366 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  31.89 
 
 		 2796 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 		 872 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  42.15 
 
 		 1806 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  34.46 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  38.68 
 
 		 535 aa  79.7  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  39.17 
 
 		 361 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  35.83 
 
 		 857 aa  77  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  43.18 
 
 		 665 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 1044 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 756 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 1247 aa  70.5  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  33.86 
 
 		 115 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  32.76 
 
 		 518 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  37.74 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 		 1317 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.65 
 
 		 418 aa  68.6  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 		 995 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.32 
 
 		 1264 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 1059 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  34.55 
 
 		 521 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  39.53 
 
 		 987 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  35.96 
 
 		 678 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  40 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  40 
 
 		 751 aa  64.7  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  34.91 
 
 		 1322 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.78 
 
 		 916 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  36.19 
 
 		 680 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  32.52 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 		 1313 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  40 
 
 		 1161 aa  59.3  0.00000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  34.26 
 
 		 1476 aa  59.3  0.00000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 1035 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  36.79 
 
 		 644 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  48.08 
 
 		 355 aa  57  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 		 882 aa  55.8  0.0000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  28.87 
 
 		 1880 aa  53.9  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  43.4 
 
 		 814 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  38.6 
 
 		 592 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  48.08 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  35.29 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  48.08 
 
 		 137 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 1301 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  47.92 
 
 		 399 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  37.88 
 
 		 513 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  43.4 
 
 		 1162 aa  49.7  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  46.15 
 
 		 137 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  35.71 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  33.07 
 
 		 2296 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  30.68 
 
 		 235 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  37.31 
 
 		 1302 aa  46.2  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  48.65 
 
 		 668 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  35.06 
 
 		 846 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  31.25 
 
 		 1313 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  34.43 
 
 		 1236 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  44.68 
 
 		 1334 aa  42.7  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  29.82 
 
 		 223 aa  42.4  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>