68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2007 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1080    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  27.18 
 
 		 916 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  29.13 
 
 		 846 aa  103  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.35 
 
 		 1161 aa  102  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.97 
 
 		 751 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  27.97 
 
 		 751 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  31.49 
 
 		 695 aa  98.2  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  28.82 
 
 		 686 aa  96.7  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.2 
 
 		 1366 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.2 
 
 		 1162 aa  94.7  4e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  28.46 
 
 		 631 aa  88.2  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  27 
 
 		 1236 aa  88.2  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  29.06 
 
 		 828 aa  85.5  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.17 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  28.79 
 
 		 1632 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  29.9 
 
 		 1806 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.12 
 
 		 588 aa  73.6  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 1082 aa  72.8  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 1322 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  30.39 
 
 		 2342 aa  72  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  30.39 
 
 		 2342 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  27.81 
 
 		 849 aa  70.1  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  30.05 
 
 		 665 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  30.06 
 
 		 1313 aa  67  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  29.94 
 
 		 1247 aa  66.2  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  27.7 
 
 		 2796 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.07 
 
 		 666 aa  61.6  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  40 
 
 		 678 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  32.74 
 
 		 581 aa  60.8  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  26.16 
 
 		 823 aa  60.1  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  38.04 
 
 		 115 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  24.86 
 
 		 1067 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  38.46 
 
 		 120 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  45.31 
 
 		 137 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 		 995 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 1301 aa  57.8  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 987 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  43.08 
 
 		 137 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  45.31 
 
 		 137 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 872 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  26.14 
 
 		 857 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 535 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  40.35 
 
 		 644 aa  55.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 		 1059 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  20.25 
 
 		 1152 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  28.66 
 
 		 1035 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  25.95 
 
 		 756 aa  53.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  51.22 
 
 		 1476 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 1152 aa  51.6  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  36.11 
 
 		 294 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  25.84 
 
 		 361 aa  50.4  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  37.88 
 
 		 305 aa  50.4  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 		 746 aa  50.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  36.21 
 
 		 255 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  26 
 
 		 793 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  37.5 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  36.23 
 
 		 294 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  36.21 
 
 		 227 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  35.53 
 
 		 597 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  34.48 
 
 		 592 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  20.87 
 
 		 606 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 		 1317 aa  44.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  34.78 
 
 		 518 aa  44.3  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  35.48 
 
 		 361 aa  44.3  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  27.06 
 
 		 1044 aa  44.3  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  40.32 
 
 		 361 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  24.43 
 
 		 223 aa  43.9  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  37.5 
 
 		 322 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>