91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3694 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  100 
 
 		 916 aa  1900    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.6 
 
 		 1366 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  26.16 
 
 		 1161 aa  194  8e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.88 
 
 		 1162 aa  181  5.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0543  hypothetical protein  35.2 
 
 		 431 aa  178  4e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.155137  normal  0.517294 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3231  hypothetical protein  30.59 
 
 		 423 aa  162  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  32.76 
 
 		 751 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  32.76 
 
 		 751 aa  152  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  27.18 
 
 		 513 aa  145  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  29.19 
 
 		 1236 aa  140  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 846 aa  138  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 828 aa  130  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  37.62 
 
 		 849 aa  114  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  34 
 
 		 665 aa  109  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 1247 aa  102  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  34.39 
 
 		 872 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 		 1067 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  31.9 
 
 		 695 aa  100  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  26.77 
 
 		 631 aa  99.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  30 
 
 		 686 aa  99.4  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  34.59 
 
 		 995 aa  99  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2750  hypothetical protein  28.44 
 
 		 736 aa  98.6  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  31.38 
 
 		 1082 aa  95.9  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  31.89 
 
 		 1035 aa  95.9  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  31.89 
 
 		 1059 aa  95.5  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.65 
 
 		 519 aa  95.1  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3349  glycosyl transferase, group 1  26.57 
 
 		 406 aa  92  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0542169  decreased coverage  0.00718656 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  30.59 
 
 		 1264 aa  89.4  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 1152 aa  88.6  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  36.84 
 
 		 1152 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  27.65 
 
 		 2342 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  27.65 
 
 		 2342 aa  86.7  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  27.52 
 
 		 1632 aa  86.3  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.52 
 
 		 1806 aa  85.9  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  34.55 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  25.67 
 
 		 606 aa  84  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  30.11 
 
 		 987 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0422  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 1297 aa  81.3  0.00000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  26.29 
 
 		 2796 aa  79.7  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  32.09 
 
 		 756 aa  79.7  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  29.61 
 
 		 857 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  30.95 
 
 		 521 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 666 aa  75.9  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  28.24 
 
 		 1322 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  26.02 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  28.3 
 
 		 1313 aa  72.8  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  32.24 
 
 		 597 aa  72.4  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  29.55 
 
 		 1600 aa  71.2  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  39.56 
 
 		 592 aa  70.1  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  29.65 
 
 		 235 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  28.76 
 
 		 823 aa  70.1  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  29.72 
 
 		 793 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 1301 aa  69.7  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  34.27 
 
 		 518 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  31.85 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  31.85 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 1044 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  31.85 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  32.19 
 
 		 535 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 1317 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  31.78 
 
 		 305 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  40.28 
 
 		 1476 aa  60.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.75 
 
 		 588 aa  60.5  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 		 882 aa  58.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  40.96 
 
 		 255 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2165  glycosyl transferase group 1  27.11 
 
 		 579 aa  55.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  34.69 
 
 		 137 aa  54.7  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  34.69 
 
 		 137 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  34.29 
 
 		 678 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  35.62 
 
 		 227 aa  52.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  32.65 
 
 		 137 aa  52  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 680 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  37.14 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  32.88 
 
 		 355 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  25.95 
 
 		 462 aa  49.7  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  34.25 
 
 		 644 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  35.14 
 
 		 115 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  39.73 
 
 		 120 aa  49.3  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2053  cell wall hydrolase/autolysin  34.48 
 
 		 1805 aa  48.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0944143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  29.01 
 
 		 361 aa  48.5  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1745  glycosyl transferase group 1  27.01 
 
 		 406 aa  47.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  29.01 
 
 		 361 aa  47.4  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  36.99 
 
 		 1302 aa  47  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  32.84 
 
 		 668 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4803  glycosyl transferase group 1  25.3 
 
 		 438 aa  45.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.70984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 		 814 aa  45.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  41.51 
 
 		 399 aa  45.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3904  hypothetical protein  26.82 
 
 		 413 aa  45.1  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5486  glycosyl transferase group 1  24.91 
 
 		 398 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2183  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 		 995 aa  44.3  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.610183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>