More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3992 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
1317 aa  2668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  40.55 
 
 
1444 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  40.85 
 
 
1287 aa  453  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  38.02 
 
 
1312 aa  439  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  42.2 
 
 
746 aa  423  1e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  38.79 
 
 
1314 aa  403  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  38.5 
 
 
1673 aa  360  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
814 aa  357  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  36.27 
 
 
987 aa  343  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
1185 aa  340  9.999999999999999e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  33.42 
 
 
1035 aa  334  5e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  33.13 
 
 
1059 aa  332  2e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  33.37 
 
 
995 aa  330  9e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  32.07 
 
 
1313 aa  311  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  31.91 
 
 
1322 aa  300  8e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  31.49 
 
 
1256 aa  265  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  33.28 
 
 
1008 aa  236  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  38.25 
 
 
953 aa  207  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  33.22 
 
 
723 aa  203  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 
850 aa  200  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
827 aa  185  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
852 aa  182  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.59 
 
 
862 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  37.17 
 
 
597 aa  176  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  35.31 
 
 
818 aa  155  5.9999999999999996e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  35.69 
 
 
818 aa  152  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
1600 aa  148  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  33.55 
 
 
1301 aa  130  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
1523 aa  120  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
1523 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  35.4 
 
 
1162 aa  116  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
680 aa  114  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 
1435 aa  110  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  32.35 
 
 
1119 aa  108  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  33.04 
 
 
1340 aa  104  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.74 
 
 
2401 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
1268 aa  103  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0502  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
355 aa  101  9e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.925562  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.99 
 
 
785 aa  100  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  44.14 
 
 
746 aa  97.8  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 
369 aa  95.9  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  38.81 
 
 
849 aa  95.1  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1946  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.37 
 
 
1191 aa  94.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678208  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  25.91 
 
 
1152 aa  94.4  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1932  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
359 aa  93.6  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.506489  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3469  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
1190 aa  93.2  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.65715  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0841  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
337 aa  93.2  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  38.58 
 
 
1067 aa  92.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  30.96 
 
 
337 aa  92  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0787  glycosyl transferase family 2  30.71 
 
 
353 aa  91.7  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.163096  normal  0.605145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  25.18 
 
 
1152 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  29.3 
 
 
279 aa  90.5  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4138  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 
624 aa  89.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  28.66 
 
 
616 aa  89.4  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3333  glycosyltransferase-like protein  29.34 
 
 
1121 aa  89  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
334 aa  89  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0684  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
350 aa  86.7  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.584656 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0546  glycosyl transferase  30.16 
 
 
348 aa  85.1  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483878  normal  0.249879 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4069  glycosyltransferase-like protein  26.44 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269356  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3368  glycosyl transferase family protein  32 
 
 
679 aa  85.1  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00886374 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1476  glycosyl transferase family protein  24.77 
 
 
1192 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.891442 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
1044 aa  84.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 
535 aa  84  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1316  glycosyl transferase  27.76 
 
 
358 aa  83.2  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.255761  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.67 
 
 
303 aa  83.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  30.62 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0432  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 
348 aa  80.9  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  40.37 
 
 
1366 aa  81.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1508  glycosyl transferase family protein  27.34 
 
 
1198 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
872 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  28.77 
 
 
658 aa  79  0.0000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
305 aa  79  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 
1759 aa  78.6  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  37.96 
 
 
1632 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  33.59 
 
 
294 aa  77.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0463  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
293 aa  77.4  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.580187 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  38.89 
 
 
1806 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  26.78 
 
 
313 aa  76.3  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1004  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  39.62 
 
 
2342 aa  75.9  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  33.59 
 
 
294 aa  76.3  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1021  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1031  glycosyl transferase family protein  32.81 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0821008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.62 
 
 
300 aa  75.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  34.75 
 
 
857 aa  76.3  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2745  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 
1267 aa  75.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.636531  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  39.62 
 
 
2342 aa  75.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
1359 aa  75.5  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0777  glycosyl transferase family 2  29.96 
 
 
280 aa  75.5  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  37.74 
 
 
2796 aa  75.5  0.000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2676  b-glycosyltransferase  26.58 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  23.85 
 
 
457 aa  73.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1299  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
470 aa  73.6  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0628268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3181  glycosyl transferase family 2  28.47 
 
 
345 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255598  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
756 aa  73.2  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 
334 aa  73.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  31.3 
 
 
294 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  38.83 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4928  glycosyl transferase family 2  31.65 
 
 
513 aa  72.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.83 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>