81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3984 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1319    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  64.44 
 
 		 115 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  59 
 
 		 120 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  49.59 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3017  hypothetical protein  56.25 
 
 		 322 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.044342  normal  0.23339 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3845  hypothetical protein  56.41 
 
 		 355 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.960919  normal  0.369617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4522  hypothetical protein  51.69 
 
 		 137 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.583974 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4982  hypothetical protein  51.69 
 
 		 137 aa  92  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.633346  normal  0.27527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5035  hypothetical protein  49.44 
 
 		 137 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.117326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  54.79 
 
 		 592 aa  85.1  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  54.93 
 
 		 872 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  52.05 
 
 		 665 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  51.43 
 
 		 1632 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  45.98 
 
 		 1806 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  52.78 
 
 		 2796 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  45.98 
 
 		 255 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2010  hypothetical protein  48.68 
 
 		 678 aa  76.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  41.38 
 
 		 849 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  40.91 
 
 		 1067 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  48.57 
 
 		 2342 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  52.78 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  48.57 
 
 		 2342 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  52.78 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  46.25 
 
 		 1264 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  52.78 
 
 		 361 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  39.74 
 
 		 746 aa  70.5  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  39.36 
 
 		 535 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  42.68 
 
 		 814 aa  69.3  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  47.22 
 
 		 521 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 		 1152 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  41.56 
 
 		 1152 aa  67.8  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  49.32 
 
 		 680 aa  67.4  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  38.67 
 
 		 1161 aa  65.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  42.22 
 
 		 857 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  32.58 
 
 		 1247 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  47.83 
 
 		 995 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  29.37 
 
 		 518 aa  61.6  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  36.07 
 
 		 1035 aa  61.2  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  44.94 
 
 		 830 aa  61.6  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  36.07 
 
 		 1059 aa  61.2  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  47.22 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  39.73 
 
 		 1366 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  39.56 
 
 		 987 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  40.85 
 
 		 1317 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0558  hypothetical protein  43.48 
 
 		 1880 aa  59.3  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2480  hypothetical protein  36.89 
 
 		 143 aa  58.9  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.696042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  40.85 
 
 		 756 aa  58.9  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 		 1313 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  35.62 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  41.54 
 
 		 1322 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  38.18 
 
 		 2296 aa  57.8  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  36.79 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  35.37 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  42.25 
 
 		 1476 aa  57  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2610  hypothetical protein  44.32 
 
 		 1313 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  40.35 
 
 		 513 aa  55.1  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2521  hypothetical protein  27.92 
 
 		 471 aa  54.7  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  39.51 
 
 		 235 aa  54.7  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 1044 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  35.23 
 
 		 1236 aa  53.9  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  37.33 
 
 		 1162 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3866  glycosyl transferase group 1  38.37 
 
 		 1302 aa  52.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.806044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0030  hemolysin-type calcium-binding region  33.62 
 
 		 462 aa  52  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.328921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  35.06 
 
 		 223 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 927 aa  49.7  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  34.25 
 
 		 916 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  35.9 
 
 		 751 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  35.9 
 
 		 751 aa  49.3  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3229  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.77 
 
 		 418 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0911391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3867  hypothetical protein  51.22 
 
 		 296 aa  48.1  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.293011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  34.25 
 
 		 846 aa  48.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1874  cell surface protein  40.74 
 
 		 603 aa  47.8  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.665345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1309  TPR domain-containing protein  33.96 
 
 		 293 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000314347  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 288 aa  46.6  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  41.18 
 
 		 399 aa  45.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0725  chromosome segregation ATPases-like  60 
 
 		 668 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.124276  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  41.94 
 
 		 597 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1650  hypothetical protein  31.25 
 
 		 380 aa  44.3  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.241847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2562  hypothetical protein  24.31 
 
 		 473 aa  44.3  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.799827  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.92 
 
 		 810 aa  44.3  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.88 
 
 		 1013 aa  44.3  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>