184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1576 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2494  glycosyl transferase family 2  44.08 
 
 
1059 aa  698    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2175  glycosyl transferase family 2  43.89 
 
 
995 aa  679    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6257  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
987 aa  721    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0286803  normal  0.0257469 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2218  glycosyl transferase family protein  44.38 
 
 
1035 aa  704    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.966726 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1204  glycosyl transferase family protein  88.16 
 
 
1322 aa  2110    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.221379  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1576  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
1313 aa  2594    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.897283 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  36.23 
 
 
814 aa  445  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1836  methyltransferase FkbM family  39.71 
 
 
1673 aa  395  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  38.1 
 
 
1312 aa  333  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3797  hypothetical protein  35.3 
 
 
1444 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4142  glycosyl transferase family protein  38.04 
 
 
1287 aa  328  4.0000000000000003e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000068759 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3992  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 
1317 aa  324  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.33593  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1318  glycosyl transferase family protein  35.76 
 
 
1314 aa  324  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.581884  normal  0.368047 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0044  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 
746 aa  322  3.9999999999999996e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2627  glycosyl transferase family protein  34.09 
 
 
1185 aa  278  6e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.112993  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2178  glycosyl transferase family protein  32.23 
 
 
1256 aa  262  4e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1895  glycosyl transferase family protein  37.69 
 
 
953 aa  228  8e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207282  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2886  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
1008 aa  206  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0431865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1793  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.07 
 
 
862 aa  199  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.101573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0930  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
827 aa  197  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0478435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1402  glycosyl transferase family protein  38.33 
 
 
852 aa  196  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0057  methyltransferase FkbM family  30.13 
 
 
723 aa  173  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1063  glycosyl transferase family protein  38.98 
 
 
818 aa  164  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0549  glycosyl transferase family protein  37.37 
 
 
818 aa  163  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0567321  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4121  glycosyl transferase family protein  30.64 
 
 
850 aa  162  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.276059  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  25.5 
 
 
1067 aa  152  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  28.09 
 
 
849 aa  150  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  33.33 
 
 
597 aa  111  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  38.35 
 
 
665 aa  109  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  40.48 
 
 
1247 aa  96.7  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  28.62 
 
 
1523 aa  95.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  29.23 
 
 
1523 aa  95.5  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  23.75 
 
 
1366 aa  92.8  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 
1435 aa  92  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6327  glycosyl transferase family 2  31.74 
 
 
872 aa  90.9  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 
1044 aa  91.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  24.13 
 
 
857 aa  90.5  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  26.91 
 
 
1268 aa  88.2  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2372  5'-Nucleotidase domain protein  33.03 
 
 
2796 aa  87.4  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.308667 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2268  glycosyl transferase family protein  30.29 
 
 
1600 aa  86.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59897  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  32.26 
 
 
2342 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  27.37 
 
 
785 aa  84.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  32.26 
 
 
2342 aa  84.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05411  putative glycosyl transferase  26.17 
 
 
387 aa  83.2  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.42422  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0724  glycosyl transferase family protein  27.61 
 
 
680 aa  81.6  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.647901  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0236  glycosyl transferase group 1  28.98 
 
 
1067 aa  82  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  36.32 
 
 
1632 aa  81.6  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.82 
 
 
916 aa  80.5  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.85 
 
 
1806 aa  79.3  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0652  putative glycosyl transferase  26.47 
 
 
1119 aa  77  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.427712 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  28.9 
 
 
1162 aa  76.3  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
994 aa  73.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
746 aa  73.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
1264 aa  73.2  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  34.84 
 
 
535 aa  72.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  28.34 
 
 
1340 aa  72.8  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1152 aa  70.1  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 
369 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3988  hypothetical protein  30.56 
 
 
521 aa  69.7  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.28439  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
1152 aa  70.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2715  glycosyl transferase family 2  36.59 
 
 
756 aa  69.7  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4882  hypothetical protein  34.19 
 
 
235 aa  68.9  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  48.48 
 
 
120 aa  68.6  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5072  hypothetical protein  35.71 
 
 
223 aa  68.2  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133636  normal  0.18429 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  26.36 
 
 
513 aa  67.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0259  glycosyl transferase family protein  25.22 
 
 
658 aa  67.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  48.48 
 
 
115 aa  67.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1100  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
924 aa  65.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0516  hypothetical protein  38.36 
 
 
592 aa  63.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0233  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.86 
 
 
315 aa  63.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.885705  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0409  glycosyl transferase family 2  27.86 
 
 
315 aa  63.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.535242  hitchhiker  0.0010651 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02687  hypothetical protein  26.76 
 
 
279 aa  62.8  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.475562  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  25.67 
 
 
860 aa  62.4  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  26.28 
 
 
334 aa  62.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3709  hypothetical protein  43.37 
 
 
255 aa  62.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  28.4 
 
 
2401 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0885  glycosyl transferase family 2  26.65 
 
 
817 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0767  glycosyl transferase family 2  24.5 
 
 
602 aa  61.6  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  57.78 
 
 
361 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1212  hypothetical protein  33.96 
 
 
305 aa  61.6  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.760628 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  43.08 
 
 
227 aa  61.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  38.58 
 
 
361 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  30.15 
 
 
447 aa  60.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  38.58 
 
 
361 aa  60.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  28.89 
 
 
518 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  36.44 
 
 
1106 aa  59.3  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  41.54 
 
 
644 aa  58.9  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3218  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 
902 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0552261  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2296  glycosyl transferase family protein  22.05 
 
 
632 aa  58.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.870587  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3684  glycosyl transferase group 1  26.1 
 
 
1400 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
298 aa  57.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4705  glycosyl transferase group 1  26.09 
 
 
440 aa  57.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.625922 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2814  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 
457 aa  57.4  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1841  glycosyl transferase family 2  26.44 
 
 
652 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333459  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2168  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 
360 aa  56.2  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  24.33 
 
 
1739 aa  56.2  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  44.62 
 
 
1476 aa  55.1  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4407  glycosyl transferase family protein  21.77 
 
 
1359 aa  54.3  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  23.02 
 
 
1759 aa  54.3  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4708  glycosyl transferase group 1  26.6 
 
 
418 aa  54.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.514087 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>