192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_B0007 on replicon NC_007641
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 1236 aa  2530    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  39.23 
 
 		 846 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  32.65 
 
 		 828 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  40.4 
 
 		 1152 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  43.94 
 
 		 956 aa  231  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1971  glycosyl transferase family 2  56.52 
 
 		 1084 aa  223  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0774  glycosyl transferase family 2  43.88 
 
 		 1476 aa  217  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1218  hypothetical protein  32.19 
 
 		 518 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2999  glycosyl transferase family 2  46.59 
 
 		 988 aa  213  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  35.97 
 
 		 1119 aa  204  7e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2408  glycosyl transferase family 2  44.7 
 
 		 1334 aa  204  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2733  glycosyltransferase-like protein  45 
 
 		 329 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1839  hypothetical protein  44.51 
 
 		 219 aa  173  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1635  hypothetical protein  43.35 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0150544  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1613  hypothetical protein  43.35 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.800747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1764  hypothetical protein  43.35 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1814  hypothetical protein  43.35 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1634  hypothetical protein  44.51 
 
 		 219 aa  169  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.257483  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1585  hypothetical protein  43.35 
 
 		 219 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189915  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1893  hypothetical protein  43.93 
 
 		 219 aa  169  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00821908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3565  hypothetical protein  44.09 
 
 		 219 aa  167  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.876515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1779  hypothetical protein  44.09 
 
 		 219 aa  165  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0835  hypothetical protein  43.35 
 
 		 223 aa  159  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  29.55 
 
 		 461 aa  159  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  29.04 
 
 		 994 aa  156  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.19 
 
 		 916 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.19 
 
 		 1366 aa  134  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  33.6 
 
 		 581 aa  107  1e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.37 
 
 		 1162 aa  95.1  8e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  29.77 
 
 		 823 aa  90.9  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  28.74 
 
 		 606 aa  90.1  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  27.12 
 
 		 406 aa  90.5  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  30.96 
 
 		 1161 aa  88.6  6e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  27 
 
 		 513 aa  88.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4195  Rhamnan synthesis F  29.75 
 
 		 631 aa  86.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.69 
 
 		 588 aa  83.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  21.72 
 
 		 1264 aa  82.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  29.92 
 
 		 793 aa  82.4  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.38 
 
 		 443 aa  80.5  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  23.14 
 
 		 399 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.38 
 
 		 643 aa  79.7  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  29.07 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  26.42 
 
 		 686 aa  78.2  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.5 
 
 		 643 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  31.28 
 
 		 751 aa  75.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  30.7 
 
 		 751 aa  75.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.31 
 
 		 666 aa  73.6  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  25.21 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4001  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 1301 aa  70.9  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.248579 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.64 
 
 		 643 aa  69.7  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  43.42 
 
 		 1247 aa  67  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6712  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 		 665 aa  65.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  24.44 
 
 		 703 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.06 
 
 		 364 aa  63.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3634  glycosyl transferase group 1  34.51 
 
 		 1044 aa  60.8  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.578618  normal  0.0749406 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 406 aa  60.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 1082 aa  60.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1250  hypothetical protein  40.26 
 
 		 849 aa  59.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0640  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  25.32 
 
 		 519 aa  59.3  0.0000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.7378  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 		 387 aa  57.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0753  hypothetical protein  37.93 
 
 		 294 aa  58.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.445777  normal  0.242223 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0906  glycosyl transferase family 2  31.25 
 
 		 1152 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  31.89 
 
 		 375 aa  57.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1525  glycosyl transferase family 2  37.04 
 
 		 857 aa  57.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  28.31 
 
 		 394 aa  57.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0933  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 1152 aa  58.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  29.8 
 
 		 440 aa  57  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05360  Glycosyl transferase, group 1  29.47 
 
 		 370 aa  56.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.012164  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4829  Animal heme peroxidase  40.45 
 
 		 2342 aa  56.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1253  glycosyl transferase group 1  31.95 
 
 		 351 aa  56.2  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.708089  normal  0.587919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6498  hypothetical protein  45.33 
 
 		 120 aa  55.8  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0526987  hitchhiker  0.0078002 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 		 377 aa  55.8  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  31.22 
 
 		 367 aa  55.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1576  glycosyl transferase family 2  37.66 
 
 		 746 aa  55.5  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 353 aa  55.5  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5612  glycosyl transferase group 1  25.23 
 
 		 763 aa  55.5  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48049  normal  0.331243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0108  Animal heme peroxidase  39.33 
 
 		 2342 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4307  Glycosyltransferase-like protein  43.24 
 
 		 597 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4000  hypothetical protein  40.58 
 
 		 399 aa  55.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 361 aa  54.3  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  37.33 
 
 		 1632 aa  54.7  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  25.43 
 
 		 363 aa  53.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 		 387 aa  53.5  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 361 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3984  hypothetical protein  35.23 
 
 		 644 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0790  hypothetical protein  37.17 
 
 		 294 aa  54.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1253  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 		 1067 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  43.24 
 
 		 361 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1140  glycosyl transferase group 1  27.1 
 
 		 386 aa  53.1  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.960546  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36 
 
 		 1806 aa  53.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6737  hypothetical protein  42.67 
 
 		 115 aa  52.4  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  22.83 
 
 		 398 aa  52.4  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5645  hypothetical protein  35.71 
 
 		 227 aa  52  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214795  normal  0.245514 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0830  hypothetical protein  41.89 
 
 		 294 aa  52  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.398779 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.88 
 
 		 366 aa  52  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  24.34 
 
 		 388 aa  51.6  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 418 aa  51.6  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6296  glycosyl transferase family 2  34.12 
 
 		 814 aa  51.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 699 aa  51.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>