31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3443 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  74.72 
 
 		 793 aa  1161    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  100 
 
 		 823 aa  1658    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  28.9 
 
 		 828 aa  235  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 461 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 		 846 aa  123  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 1236 aa  90.9  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 1264 aa  80.5  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  31.33 
 
 		 695 aa  74.3  0.000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3694  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.76 
 
 		 916 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  27.51 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.51 
 
 		 751 aa  69.3  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 		 406 aa  67.8  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  27.03 
 
 		 1247 aa  67.4  0.0000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.39 
 
 		 443 aa  66.6  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.75 
 
 		 643 aa  66.6  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.63 
 
 		 643 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  29.77 
 
 		 686 aa  62.8  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  24.3 
 
 		 643 aa  61.6  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.12 
 
 		 643 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2007  hypothetical protein  26.16 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.836412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4336  Lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.72 
 
 		 1366 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.350964  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0633  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.14 
 
 		 1161 aa  57  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1572  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.87 
 
 		 666 aa  56.6  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.211326  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1432  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 581 aa  56.2  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.763455  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4462  Rhamnan synthesis F  26.07 
 
 		 606 aa  57  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 406 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  28 
 
 		 399 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 386 aa  52.4  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2036  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  27.53 
 
 		 1162 aa  50.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0212  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 588 aa  49.7  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  44.68 
 
 		 423 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>