More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2777 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2777  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
406 aa  835    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2576  glycosyl transferase group 1  43.92 
 
 
406 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.731131  normal  0.452849 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0039  glycosyl transferase group 1  33.75 
 
 
399 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3238  glycosyl transferase family protein  28.36 
 
 
703 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2403  glycosyl transferase, group 1  27.54 
 
 
828 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0266  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0310  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.61 
 
 
643 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0340  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.3 
 
 
643 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0259  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 
643 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3964  glycosyl transferase group 1  27.23 
 
 
1264 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0126  glycosyl transferase group 1  25.45 
 
 
699 aa  109  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.699661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0325  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.17 
 
 
643 aa  106  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347044  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4197  glycosyl transferase, group 1  27.18 
 
 
846 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0007  glycosyl transferase, group 1  27.12 
 
 
1236 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1502  glycosyltransferase  25.19 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0158  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1276  glycosyl transferase group 1  29.93 
 
 
378 aa  79.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.680838  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2357  Glycosyltransferase-like protein  23.63 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.61542  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3551  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
371 aa  78.2  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.185108  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0689  glycosyl transferase, group 1  26.94 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  24.93 
 
 
1247 aa  73.6  0.000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0155  glycosyl transferase, group 1  27.46 
 
 
361 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2306  glycosyl transferase group 1  27.57 
 
 
461 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  26.72 
 
 
745 aa  69.7  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2808  glycosyl transferase group 1  23.62 
 
 
424 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0358  glycosyl transferase group 1  22.83 
 
 
364 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.662771 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.91 
 
 
373 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0305  hypothetical protein  30.34 
 
 
423 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1702  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.46 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1445  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1417  glycosyltransferase  25.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1418  glycosyltransferase  25.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  28.15 
 
 
377 aa  68.2  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1629  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.170146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1558  group 1 family glycosyl transferase  25.93 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1374  putative lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase protein  23.69 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.95954  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 
364 aa  67.4  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.35 
 
 
394 aa  67.4  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2072  glycosyl transferase group 1  32.89 
 
 
374 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2715  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
421 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.770455 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1425  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 
468 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.703524  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  28.49 
 
 
374 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  30.14 
 
 
377 aa  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0148  glycosyl transferase group 1  24.64 
 
 
380 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.02 
 
 
419 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0013  glycosyl transferase, group 1  22.27 
 
 
389 aa  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.636661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2363  glycosyl transferase, group 1  26.75 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1664  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.4 
 
 
381 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0498  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
378 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1419  glycosyl transferase, group 1  26.69 
 
 
365 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1591  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 
381 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5739  putative glycosyl transferase  26.02 
 
 
378 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1099  glycosyl transferase, group 1  24.15 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.209796  normal  0.0258816 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.04 
 
 
375 aa  63.9  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1107  glycosyl transferase group 1  33.91 
 
 
399 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  25.65 
 
 
394 aa  63.2  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  23.5 
 
 
378 aa  63.2  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4161  glycosyl transferase group 1  26.79 
 
 
392 aa  63.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3754  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.81 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  24.21 
 
 
374 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3443  hypothetical protein  32.82 
 
 
823 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0239655  normal  0.271083 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0249  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000132776  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
739 aa  62  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5389  glycosyl transferase, group 1, putative  21.81 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66160  putative glycosyl transferase  25.65 
 
 
378 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.266324  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
355 aa  62  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  25.61 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1792  glycosyl transferase group 1  31.39 
 
 
365 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2606  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 
398 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2977  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 
352 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.179436  normal  0.153707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3302  glycosyl transferase, group 1  23.51 
 
 
387 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5687  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
765 aa  60.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  35.25 
 
 
440 aa  60.5  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
395 aa  60.5  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  25.2 
 
 
376 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 
394 aa  60.5  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3988  glycosyltransferase  32.77 
 
 
793 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2121  glycosyl transferase group 1  23.05 
 
 
375 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  27.98 
 
 
373 aa  60.1  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0642  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
463 aa  60.1  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.36 
 
 
423 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02226  hypothetical protein  25.08 
 
 
394 aa  59.7  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3644  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
478 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0102527  decreased coverage  0.0000773484 
 
 
-
 
NC_004310  BR1503  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  26.23 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1453  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase LpcC  26.23 
 
 
354 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1461  glycosyl transferase group 1  23.4 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.244211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0474  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249061  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1346  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3847  glycosyl transferase, group 1  25.5 
 
 
360 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0487  glycosyl transferase group 1  23.66 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000304875  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  30.36 
 
 
422 aa  58.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.35 
 
 
375 aa  58.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2004  glycosyl transferase, group 1  26.64 
 
 
403 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5864  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 
394 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2716  glycosyl transferase group 1  23.99 
 
 
352 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  22.5 
 
 
387 aa  58.5  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3481  glycosyl transferase group 1  25.73 
 
 
344 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2254  glycosyl transferase group 1  25.98 
 
 
390 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0723451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>