More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4833 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
375 aa  773    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  54.45 
 
 
372 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  54.52 
 
 
372 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  48.4 
 
 
400 aa  354  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  47.59 
 
 
369 aa  327  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  48.36 
 
 
381 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  37.6 
 
 
386 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  28.95 
 
 
381 aa  162  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  32.81 
 
 
343 aa  160  5e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  30.39 
 
 
374 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  33.43 
 
 
343 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.06 
 
 
343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  30.3 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 
374 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  30.3 
 
 
374 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  36.86 
 
 
379 aa  126  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
374 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  34.39 
 
 
378 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  29.88 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  29.88 
 
 
373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  29.27 
 
 
373 aa  119  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
376 aa  113  6e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 
371 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  27.61 
 
 
408 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.05 
 
 
374 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  37.33 
 
 
434 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  29.18 
 
 
419 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 
378 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  28.97 
 
 
409 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  26.38 
 
 
373 aa  106  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.16 
 
 
391 aa  106  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  33.19 
 
 
394 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  28.35 
 
 
374 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.91 
 
 
374 aa  104  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  32.26 
 
 
394 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.91 
 
 
374 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  27.46 
 
 
390 aa  104  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
394 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
394 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 
377 aa  104  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  25.77 
 
 
373 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  27.45 
 
 
351 aa  103  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.64 
 
 
374 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.64 
 
 
374 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  27.64 
 
 
374 aa  103  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.59 
 
 
390 aa  102  8e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  28.8 
 
 
374 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
394 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  32.62 
 
 
386 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  27.99 
 
 
409 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  32.86 
 
 
392 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0577  glycosyl transferase, group 1  33.05 
 
 
355 aa  100  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.18 
 
 
419 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.39 
 
 
389 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  32.33 
 
 
394 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.88 
 
 
419 aa  100  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  26.45 
 
 
403 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  26.5 
 
 
377 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 
398 aa  100  6e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  26.68 
 
 
400 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  24.75 
 
 
408 aa  99.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.07 
 
 
374 aa  99.8  7e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 
381 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  28.07 
 
 
404 aa  99  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 
411 aa  98.6  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.77 
 
 
374 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
391 aa  97.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.46 
 
 
374 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  26.46 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  25.91 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.77 
 
 
374 aa  97.4  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  26.46 
 
 
374 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  30.08 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  30.11 
 
 
391 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.46 
 
 
374 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.51 
 
 
446 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
401 aa  94.7  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  36.56 
 
 
405 aa  94.4  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  25.37 
 
 
391 aa  94.4  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0673  glycosyl transferase group 1  31.66 
 
 
371 aa  93.2  7e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
415 aa  92.8  8e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3289  putative LPS biosynthesis-related protein  27.6 
 
 
358 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.502045  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 
378 aa  92.4  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 
394 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.97 
 
 
394 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.53 
 
 
340 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  32.97 
 
 
394 aa  91.3  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.97 
 
 
394 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  25.58 
 
 
381 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  36.87 
 
 
425 aa  91.3  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  25.99 
 
 
396 aa  90.9  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2402  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
355 aa  90.1  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.923464  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2007  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 
355 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.909403  normal  0.304999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1251  phosphatidylserine decarboxylase  26.33 
 
 
343 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302501  normal  0.631326 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  32 
 
 
394 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1256  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.121425  normal  0.610922 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>