More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0900 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 381 aa  789    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  34.03 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  31.78 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  31.68 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  32.64 
 
 		 386 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  32.17 
 
 		 381 aa  170  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  28.96 
 
 		 372 aa  145  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  27.82 
 
 		 343 aa  123  7e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  25.9 
 
 		 364 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.81 
 
 		 343 aa  122  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  28.34 
 
 		 404 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  25.14 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 401 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  26.33 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.95 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  25.86 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  34.11 
 
 		 381 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  30.93 
 
 		 400 aa  101  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  28.82 
 
 		 392 aa  99.8  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  25.93 
 
 		 374 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  36.02 
 
 		 378 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  25.93 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  25.93 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.14 
 
 		 374 aa  96.7  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.14 
 
 		 374 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 		 377 aa  96.3  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  26.14 
 
 		 374 aa  95.9  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 373 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  26.68 
 
 		 394 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  25.84 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.53 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.53 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.84 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.53 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.84 
 
 		 374 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  30.19 
 
 		 2401 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  38.37 
 
 		 391 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  33.03 
 
 		 386 aa  93.2  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  24.84 
 
 		 373 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.98 
 
 		 378 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  26.21 
 
 		 369 aa  92.8  9e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0444  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 		 387 aa  92  1e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.990869 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.53 
 
 		 374 aa  92  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 495 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 498 aa  91.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  26.2 
 
 		 408 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  30.99 
 
 		 422 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  27.96 
 
 		 394 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 499 aa  92  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 372 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.89 
 
 		 443 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  25.23 
 
 		 374 aa  90.9  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  30.83 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  25.47 
 
 		 374 aa  90.1  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  27.68 
 
 		 394 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  32.11 
 
 		 377 aa  89.4  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  26.87 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  27.57 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0798  glycosyl transferase group 1  32.09 
 
 		 396 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.607654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  27.7 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 389 aa  87.4  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  24.76 
 
 		 373 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  29.34 
 
 		 413 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  28.42 
 
 		 415 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  24.14 
 
 		 374 aa  86.3  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5192  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 404 aa  86.3  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.11 
 
 		 395 aa  86.3  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.22 
 
 		 419 aa  86.3  9e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  24.14 
 
 		 374 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  31.15 
 
 		 379 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1173  glycogen synthase  29.41 
 
 		 404 aa  85.9  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0423768 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1199  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1208  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.79 
 
 		 405 aa  85.1  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1911  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365858  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1358  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.33 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  22.22 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  32.57 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0329  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1046  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0822  lipooligosaccharide glycosyl transferase G  26.26 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  34.34 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  25.6 
 
 		 376 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  23.82 
 
 		 536 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  23.06 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>