More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0368 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  99.47 
 
 		 374 aa  764    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  86.25 
 
 		 373 aa  665    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  86.52 
 
 		 373 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  87.6 
 
 		 373 aa  674    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  98.66 
 
 		 374 aa  762    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 374 aa  768    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  81.77 
 
 		 373 aa  635    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  94.65 
 
 		 374 aa  736    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  81.67 
 
 		 373 aa  632  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  80.48 
 
 		 374 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  77.54 
 
 		 374 aa  602  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  51.49 
 
 		 371 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  52.16 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  52.16 
 
 		 374 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  52.16 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  52.16 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.89 
 
 		 374 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  51.08 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  51.74 
 
 		 374 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  51.47 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.21 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  51.47 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.21 
 
 		 374 aa  396  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.47 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.21 
 
 		 374 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  51.21 
 
 		 374 aa  394  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  48.4 
 
 		 377 aa  345  8.999999999999999e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  47.3 
 
 		 378 aa  336  5e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  40.5 
 
 		 391 aa  287  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  39.48 
 
 		 364 aa  256  3e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  40.16 
 
 		 372 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  36.63 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  35.22 
 
 		 371 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  34.04 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  32.46 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  31.86 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  30.3 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 381 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  26.43 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  26.97 
 
 		 372 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  24.85 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 386 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  25.23 
 
 		 369 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  23.64 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 408 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  24.55 
 
 		 378 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  28.31 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.21 
 
 		 427 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  23.21 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  28.35 
 
 		 443 aa  77  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2765  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.54 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.367187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 386 aa  74.7  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0723  glycosyl transferase group 1  26.64 
 
 		 381 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  25.88 
 
 		 404 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  22.74 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0812  UDP-N-acetylglucosamine--N-acetylmuramyl- (pentapeptide) pyrophosphoryl-undecaprenol  25.78 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  23.39 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2836  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0535409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  24.27 
 
 		 374 aa  73.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  25.7 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  22.69 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0454  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0138667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  31.53 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0238  glycosyl tranferase  29.01 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0185  glycosyl tranferase  29.01 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.472574  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.07 
 
 		 440 aa  70.1  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  24.19 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  26.8 
 
 		 432 aa  69.3  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.36 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1847  glycosyl transferase group 1  24.86 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  28.33 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  24.5 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1273  glycosyl transferase, group 1  24.12 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681714 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  26.82 
 
 		 448 aa  68.2  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.33 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.05 
 
 		 366 aa  67.8  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.41 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  25.42 
 
 		 457 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  24.74 
 
 		 406 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  26.82 
 
 		 394 aa  67  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  29.05 
 
 		 448 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  26.17 
 
 		 434 aa  66.2  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.52 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  29.25 
 
 		 482 aa  66.2  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  29.32 
 
 		 370 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  30.68 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1089  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0606318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  23.66 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28.38 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  32.43 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  20.13 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  31.06 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  24.67 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  28.82 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  32.03 
 
 		 392 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>