More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0319 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0319  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 378 aa  768    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.661242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2793  glycosyl transferase, group 1  75.47 
 
 		 377 aa  575  1.0000000000000001e-163  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.09685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44840  Lipopolysaccharide core biosynthesis protein  47.84 
 
 		 374 aa  342  8e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0371  glycosyl transferase group 1  47.84 
 
 		 374 aa  339  5e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.145576  normal  0.379585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0343  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  47.57 
 
 		 374 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.213865  normal  0.829668 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0522  glycosyl transferase, group 1  46.4 
 
 		 373 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.62557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4860  glycosyl transferase group 1  47.57 
 
 		 374 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.480448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0368  glycosyl transferase, group 1  47.3 
 
 		 374 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4002  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  45.97 
 
 		 374 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.04812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4047  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  45.97 
 
 		 374 aa  332  6e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.40753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3921  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  45.97 
 
 		 374 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.149392  hitchhiker  0.00193824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3939  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  45.97 
 
 		 374 aa  332  8e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4109  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  45.97 
 
 		 374 aa  332  9e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein WaaG  45.87 
 
 		 373 aa  328  8e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0467  glycosyl transferase, group 1  46.24 
 
 		 373 aa  328  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4376  glycosyl transferase group 1  44.86 
 
 		 371 aa  325  8.000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0581  glycosyl transferase, group 1  45.72 
 
 		 374 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0475822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  44.89 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  44.89 
 
 		 374 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5745  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  46.13 
 
 		 373 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.856314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  44.89 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  44.62 
 
 		 374 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  44.62 
 
 		 374 aa  319  5e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  44.62 
 
 		 374 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  44.35 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  44.62 
 
 		 374 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66230  UDP-glucose:(heptosyl) LPS alpha 1,3-glucosyltransferase WaaG  45.95 
 
 		 373 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0754  glycosyl transferase, group 1  40.51 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.100141 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0074  glycosyl transferase group 1  43.51 
 
 		 374 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1274  glucosyltransferase I  40.51 
 
 		 364 aa  269  7e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2544  glycosyl transferase, group 1  34.49 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2805  glycosyl transferase group 1  34.38 
 
 		 372 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2925  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 		 373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4088  glycosyl transferase, group 1  34.84 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4237  glycosyl transferase, group 1  34.91 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.905319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1342  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 366 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  30.79 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 372 aa  122  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  27.89 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  27.85 
 
 		 374 aa  97.1  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  26.84 
 
 		 381 aa  94.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 400 aa  94  4e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  26.32 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  28.7 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  35.07 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  27.19 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.01 
 
 		 427 aa  73.6  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6757  UDP-N-acetylglucosamine  33.02 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0354  glycosyl transferase group 1  26.92 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000079613  normal  0.480518 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  31.01 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0847  glycosyl transferase group 1  31.89 
 
 		 381 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00663707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10494  mannosyltransferase  33.87 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00261948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  33.58 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  33.12 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.22 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  30.7 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  36.3 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0650  glycosyl transferase, group 1  33.51 
 
 		 439 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303118  normal  0.416053 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0769  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 		 358 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0799  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  34.25 
 
 		 438 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0904  glycosyltransferase  26.16 
 
 		 430 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  36.81 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0552  glycosyl transferase  29.35 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.219482 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1111  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.16 
 
 		 427 aa  68.2  0.0000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  31.69 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3643  glycosyl transferase, group 1  34.9 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.590189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1635  glycosyl transferase, group 1  29.73 
 
 		 623 aa  67.8  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030735  normal  0.881168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0511  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1454  glycosyl transferase group 1  21.94 
 
 		 374 aa  67  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0515255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 		 389 aa  67  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  36.27 
 
 		 407 aa  66.6  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2591  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 		 373 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  34.68 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  33.87 
 
 		 394 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6871  glycosyl transferase group 1  26.22 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  33.15 
 
 		 417 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  22.95 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  22.87 
 
 		 391 aa  66.2  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0291  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3923  glycosyl transferase group 1  24.83 
 
 		 356 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  31.58 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003535  glycosyltransferase  27.31 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  22.95 
 
 		 398 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  31.02 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2126  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.86 
 
 		 366 aa  64.7  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  32.28 
 
 		 406 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  34.78 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  30.97 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2096  glycosyltransferase  29.17 
 
 		 415 aa  63.9  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>