More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6086 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
434 aa  855    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1546  glycosyl transferase, group 1  35.24 
 
 
400 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0752517  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0592  glycosyltransferase-like protein  30.1 
 
 
379 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0113  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 
369 aa  120  6e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4833  glycosyl transferase group 1  37.32 
 
 
375 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163337  hitchhiker  0.0000460979 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0900  glycosyl transferase group 1  32.82 
 
 
381 aa  114  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5000  glycosyl transferase group 1  32.66 
 
 
389 aa  110  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.704682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2597  putative glycosyltransferase  30.3 
 
 
374 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1351  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.23 
 
 
390 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0615  glycosyl transferase, group 1  31.55 
 
 
377 aa  105  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
426 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3950  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 
372 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0169  glycosyl transferase group 1  32.18 
 
 
372 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 
411 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3731  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
394 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607856  normal  0.812529 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5554  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
394 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731163  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0373  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
386 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  29.39 
 
 
419 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2268  glycosyl transferase, group 1  30.25 
 
 
394 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.459114  normal  0.160076 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1425  glycosyl transferase group 1  32.38 
 
 
436 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3696  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 
394 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651098  normal  0.816575 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4535  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
394 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0532155  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3828  glycosyl transferase, group 1  30.28 
 
 
394 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146208  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  27.07 
 
 
400 aa  100  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 
386 aa  100  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2238  putative glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 
409 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.24 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2615  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.97 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0212  glycogen synthase  26.18 
 
 
388 aa  98.2  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0478  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.3 
 
 
343 aa  98.2  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1236  WabG  26.02 
 
 
343 aa  97.8  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2477  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.97 
 
 
394 aa  97.8  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333211  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0910  putative glycosyltransferase  31.43 
 
 
394 aa  97.8  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.464467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 
378 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 
398 aa  95.9  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  36.12 
 
 
446 aa  94.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1409  WabG  23.02 
 
 
343 aa  94.7  3e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.607394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1963  glycosyl transferase group 1  28.61 
 
 
409 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1381  glycosyl transferase group 1  30 
 
 
391 aa  93.6  7e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0153  glycosyl transferase, group 1  30.96 
 
 
381 aa  93.2  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1098  glycosyl transferase group 1  28 
 
 
408 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.152067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 
378 aa  92.8  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  31.22 
 
 
423 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1737  glycosyl transferase, group 1  28.12 
 
 
403 aa  92  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  29.2 
 
 
374 aa  91.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0538  glycosyl transferase group 1  29.58 
 
 
391 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01600  glycogen synthase  25.5 
 
 
404 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0166  glycosyl transferase group 1  32.31 
 
 
374 aa  90.5  6e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  35.78 
 
 
403 aa  90.1  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0230  glycosyl transferase group 1  27.37 
 
 
369 aa  89.7  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1122  glycosyl transferase, group 1  29.12 
 
 
381 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0425173 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
391 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.83 
 
 
382 aa  89.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2085  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 
401 aa  89  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.94 
 
 
424 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  32.42 
 
 
482 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3582  glycosyl transferase group 1  30.08 
 
 
381 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.89 
 
 
420 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  29.8 
 
 
397 aa  88.2  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4911  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
394 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527182  hitchhiker  0.000729533 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.62 
 
 
448 aa  87.8  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  26.81 
 
 
369 aa  88.2  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  35.78 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  32.03 
 
 
438 aa  87.8  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0080  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 
374 aa  87  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.439798  hitchhiker  0.0000576629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0551  glycosyltransferase  28.39 
 
 
394 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.268857  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1972  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 
361 aa  87.4  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0575164 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5565  glycosyl transferase group 1  36.45 
 
 
810 aa  87  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.896864 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1039  glycosyl transferase, group 1  28.93 
 
 
413 aa  86.7  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1977  glycosyl transferase, group 1  29.82 
 
 
404 aa  86.7  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.665081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2372  glycosyl transferase, group 1  35.96 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.732911  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3840  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  29.12 
 
 
374 aa  86.3  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000503275  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  31.72 
 
 
390 aa  86.3  9e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03488  glucosyltransferase I  28.74 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4039  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.63 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03440  hypothetical protein  28.74 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3932  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.63 
 
 
381 aa  85.9  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  30.56 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4100  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.63 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.564193  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  31.35 
 
 
439 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1106  glycosyl transferase, group 1  32.09 
 
 
364 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.525955  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  28.34 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3966  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.74 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0237842  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  31.23 
 
 
424 aa  85.5  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4432  glycosyl transferase, group 1  30.61 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.224895  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4056  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.74 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  28.45 
 
 
414 aa  85.1  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4132  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.74 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000485252  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5001  lipopolysaccharide core biosynthesis protein RfaG  28.74 
 
 
374 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0164155  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3913  lipopolysaccharide 1,2-N-acetylglucosaminetransferase  29.63 
 
 
381 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.735836  normal  0.0414199 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1426  glycosyl transferase group 1  27.39 
 
 
536 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  28.51 
 
 
402 aa  84.7  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1027  glycosyl transferase group 1  31.51 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.49 
 
 
392 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.59 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>