More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1496 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1496  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 
374 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  28.3 
 
 
411 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  27.7 
 
 
360 aa  117  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0965  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
398 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.699884  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0792  glycosyl transferase group 1  25.38 
 
 
375 aa  107  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0136  glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
417 aa  105  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0202  glycosyl transferase, group 1  26.56 
 
 
369 aa  103  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1622  glycosyl transferase group 1  26.33 
 
 
402 aa  102  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5094  glycosyl transferase group 1  26.44 
 
 
382 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2860  glycosyltransferase  25 
 
 
430 aa  101  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0199  glycosyl transferase group 1  27.84 
 
 
394 aa  101  2e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00799925  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2773  glycosyl transferase, group 1  27.56 
 
 
430 aa  100  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0245  glycosyl transferase group 1  26.37 
 
 
396 aa  100  6e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0172332  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2128  glycosyl transferase group 1  26.53 
 
 
435 aa  99  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.555992 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0957  glycosyl transferase, group 1  27.43 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.258156  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1852  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  23.88 
 
 
769 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1596  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
386 aa  96.7  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2152  glycosyl transferase, group 1  33.85 
 
 
387 aa  95.9  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0839  glycosyl transferase group 1  33.18 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0770239  normal  0.045052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 
390 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1287  glycosyl transferase group 1  26.65 
 
 
392 aa  94  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  29.74 
 
 
390 aa  93.6  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1602  hypothetical protein  26.7 
 
 
388 aa  93.2  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 
391 aa  93.6  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1187  glycosyl transferase group 1  27.54 
 
 
431 aa  93.2  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  24.53 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2063  glycosyl transferase, group 1  25.26 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  27.65 
 
 
396 aa  93.2  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0959  glycosyl transferase group 1  26.29 
 
 
388 aa  93.2  7e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3091  glycosyl transferase, group 1  27.72 
 
 
770 aa  93.2  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278852  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1091  glycosyl transferase group 1  29.61 
 
 
378 aa  92.8  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3145  glycosyl transferase, group 1  30.81 
 
 
427 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.116626  normal  0.0485856 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0387  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.14 
 
 
408 aa  92  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.270074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  28.46 
 
 
395 aa  92  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17190  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
387 aa  91.7  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.26 
 
 
376 aa  90.9  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1972  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 
415 aa  90.5  4e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2141  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
394 aa  90.1  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.835748  hitchhiker  0.00544709 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22830  glycosyl transferase group 1  24.56 
 
 
385 aa  90.1  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3958  glycosyl transferase group 1  26.48 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  29.8 
 
 
423 aa  89.7  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0901  hypothetical protein  27.27 
 
 
372 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3119  group 1 glycosyl transferase  28.79 
 
 
400 aa  89.7  8e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0790  glycosyl transferase group 1  32.04 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.880874  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1144  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
386 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.157277  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  29.41 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0461  lipopolysaccharide biosynthesis-related protein  20.45 
 
 
383 aa  87.8  3e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00755363  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  29.41 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3236  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
393 aa  87.4  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0603  glycosyl transferase group 1  26.52 
 
 
391 aa  87.4  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  27.23 
 
 
367 aa  87.4  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0690  glycosyl transferase, group 1  24.87 
 
 
393 aa  87  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0992271  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3009  glycosyl transferase, group 1  24.8 
 
 
743 aa  86.7  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.188402  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0978  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.73 
 
 
382 aa  86.3  8e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000355781  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  26.07 
 
 
382 aa  86.3  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  26.05 
 
 
410 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0362  glycosyl transferase group 1  27.92 
 
 
380 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0673622  normal  0.109102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6393  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.59 
 
 
398 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2034  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.36 
 
 
385 aa  85.1  0.000000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  24.09 
 
 
401 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  27.2 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_851  glycosyltransferase  30.77 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000209144  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
377 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.81 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2160  glycosyl transferase, group 1  23.75 
 
 
461 aa  84.7  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.355932  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3140  glycosyl transferase group 1  25.86 
 
 
381 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1509  glycosyl transferase, group 1  29.29 
 
 
425 aa  85.1  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1133  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  24.02 
 
 
377 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0428  glycogen synthase  23.55 
 
 
404 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.743156  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1323  1,2-diacylglycerol 3-glucosyltransferase  25.77 
 
 
405 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4881  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.97 
 
 
380 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  24.21 
 
 
405 aa  84  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11160  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 
383 aa  83.6  0.000000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6086  glycosyl transferase group 1  29.2 
 
 
434 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964104  decreased coverage  0.00104043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  27.66 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  25.53 
 
 
455 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3273  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  27.24 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.949918  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  28.69 
 
 
361 aa  83.6  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1696  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
406 aa  83.2  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  27.46 
 
 
383 aa  83.2  0.000000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1498  glycosyl transferase, group 1  30.19 
 
 
373 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0598  glycosyl transferase group 1  23.6 
 
 
385 aa  83.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.87 
 
 
426 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0395  glycosyl transferase, group 1  23.23 
 
 
396 aa  82.8  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.288047  normal  0.0226805 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
377 aa  82.8  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1960  glycosyl transferase group 1  23.69 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000390342  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2826  glycosyl transferase group 1  26.24 
 
 
414 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
364 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  26.67 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  25.78 
 
 
370 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1717  glycosyl transferase, group 1  28.73 
 
 
426 aa  82.4  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.21193  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  25.76 
 
 
409 aa  82  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2565  glycosyl transferase group 1  30.29 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  25.17 
 
 
382 aa  81.6  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  26.62 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0300  glycosyl transferase, group 1  24.36 
 
 
398 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.122036  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1817  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
385 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>