More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5500 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1051  glycosyl transferase, group 1  83.64 
 
 		 445 aa  648    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.876229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5500  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 455 aa  899    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0983279 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0193  glycosyl transferase, group 1  37.85 
 
 		 398 aa  213  4.9999999999999996e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0211  glycosyl transferase group 1  36.01 
 
 		 393 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0831973 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0402  glycosyl transferase group 1  36.09 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0242  glycosyl transferase, group 1  34.07 
 
 		 386 aa  190  5.999999999999999e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.19746 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0209  glycosyl transferase, group 1  33.15 
 
 		 386 aa  187  4e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.959787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0426  glycosyl transferase, group 1  32.97 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129812  normal  0.34158 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3000  glycosyl transferase, group 1  35.95 
 
 		 384 aa  187  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0763479  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0229  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 386 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0736189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10227  hypothetical protein  32.79 
 
 		 384 aa  180  4.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.990297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4957  glycosyl transferase group 1  36.87 
 
 		 518 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0837434  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3993  glycosyl transferase group 1  37.12 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.083077  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0483  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0219  glycosyl transferase, group 1  32.75 
 
 		 360 aa  160  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1495  glycosyl transferase, group 1  29.49 
 
 		 361 aa  160  6e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.507628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1167  glycosyl transferase, group 1  35.21 
 
 		 605 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.290628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5300  glycosyl transferase group 1  33.67 
 
 		 565 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.225407  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5675  glycosyl transferase group 1  32.53 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.333063 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0230  glycosyl transferase group 1  34.41 
 
 		 499 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4469  glycosyl transferase group 1  31.47 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0769269  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1470  Glycosyltransferase-like protein  34.25 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.755998 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3707  glycosyl transferase group 1  33.24 
 
 		 468 aa  143  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2468  putative glycosyltransferase  32.63 
 
 		 448 aa  143  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0804  group 1 glycosyl transferase  32.97 
 
 		 425 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1844  glycosyl transferase, group 1  29.81 
 
 		 348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0112136  normal  0.849327 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2671  glycosyl transferase, group 1  38.21 
 
 		 408 aa  108  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.990429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8224  UDP-N-acetylglucosamine  34.48 
 
 		 427 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  33.99 
 
 		 443 aa  105  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  34.29 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1008  glycosyl transferase group 1  20.87 
 
 		 353 aa  104  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000479257  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 386 aa  103  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0588  glycosyl transferase group 1  23.97 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00564235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1912  galactosyltransferase  26.89 
 
 		 389 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0494  UDP-N-acetylglucosamine  34.93 
 
 		 428 aa  102  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  33.59 
 
 		 448 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  36.86 
 
 		 420 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1456  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4609  UDP-N-acetylglucosamine  35.5 
 
 		 450 aa  99  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  26.76 
 
 		 360 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  31.58 
 
 		 434 aa  97.8  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  28.89 
 
 		 366 aa  96.7  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4336  UDP-N-acetylglucosamine  34.21 
 
 		 429 aa  96.3  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.913017 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0956  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.37 
 
 		 435 aa  96.3  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  36.09 
 
 		 424 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  36.07 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4935  UDP-N-acetylglucosamine  35.4 
 
 		 466 aa  94.4  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  30.89 
 
 		 366 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  33.49 
 
 		 414 aa  94.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 448 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2683  glycosyl transferase group 1  32.34 
 
 		 390 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1724  glycosyl transferase, group 1  31.17 
 
 		 383 aa  93.6  7e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.4293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  27.51 
 
 		 458 aa  93.2  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2641  group 1 glycosyl transferase  36.36 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.102674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  32.37 
 
 		 439 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 482 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  31.58 
 
 		 385 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0827  glycosyl transferase, group 1  34.89 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  28.14 
 
 		 382 aa  91.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0008  glycosyl transferase group 1  25.82 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0627  UDP-N-acetylglucosamine  33.47 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  36.2 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2137  glycosyl transferase group 1  36.12 
 
 		 440 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.875323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  31.33 
 
 		 417 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  34.88 
 
 		 386 aa  90.5  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0615  glycosyl transferase, group 1  36.46 
 
 		 420 aa  90.1  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0722468  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0766  glycosyl transferase group 1  36.46 
 
 		 420 aa  90.1  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.676437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  26.14 
 
 		 414 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0456  glycosyl transferase, group 1  34.35 
 
 		 435 aa  89  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.778621  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3735  glycosyl transferase group 1  29.17 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4959  glycosyl transferase group 1  29.08 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1096  glycosyl transferase group 1  25.95 
 
 		 392 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.767278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0695  UDP-N-acetylglucosamine  32.05 
 
 		 431 aa  88.2  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4955  glycosyl transferase group 1  28.39 
 
 		 405 aa  87.8  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.5 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  28.81 
 
 		 375 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  35.05 
 
 		 350 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02650  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  32.89 
 
 		 431 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.298746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  35.53 
 
 		 364 aa  87  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5496  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0183  glycosyl transferase, group 1  27.94 
 
 		 476 aa  86.7  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  26.49 
 
 		 394 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 419 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 448 aa  86.3  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0126  glycosyl transferase group 1  31.63 
 
 		 371 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0569  glycosyl transferase group 1  33.94 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0485  glycosyl transferase group 1  29.37 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.014159  hitchhiker  0.000000311684 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1401  glycosyl transferase group 1  35.6 
 
 		 426 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.52181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 384 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0537  glycosyl transferase, group 1 family protein  31.14 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  33.18 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4652  glycosyl transferase group 1  31.08 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  34.09 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 366 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0302  glycosyltransferase  29.26 
 
 		 383 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0388  glycosyltransferase  29.31 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.230246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.16 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.379632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>